被告对原告主体不适格的异议，通常应在答辩期间提出，具体分析如下：

1. 答辩期间提出异议：

   • 根据《中华人民共和国民事诉讼法》的相关规定，被告在收到起诉状副本后，有权在法定的答辩期间内提出答辩意见。这期间，被告可以对原告的主体资格提出异议，认为原告并非适格的诉讼主体，从而质疑诉讼的合法性。
   • 答辩期间是被告准备答辩材料、提出抗辩理由的重要阶段，被告应充分利用这一期间，对原告的主体资格进行审查，并在必要时提出异议。

2. 异议提出的方式与内容：

   • 被告提出原告主体不适格的异议时，应当以书面形式提出，并明确说明异议的理由和依据。这有助于法院对异议进行审查，并作出相应的处理。
   • 异议内容应具体、明确，指出原告在哪些方面不符合诉讼主体的资格要求，如原告是否具备法律上的主体资格、是否与案件有利害关系等。

3. 异议提出的法律后果：

   • 如果被告提出的异议成立，法院可能会裁定驳回原告的起诉，因为原告主体不适格意味着诉讼无法继续进行。
   • 如果被告未在答辩期间内提出异议，或者在后续诉讼过程中才提出，法院可能会认为被告已经默认了原告的主体资格，从而不予采纳其异议。

4. 特殊情况下的异议提出：

   • 在某些特殊情况下，如被告在答辩期间后才发现原告主体不适格的事实，被告可以向法院申请追加或变更当事人，或者提出中止诉讼的申请，以待相关事实查明后再恢复诉讼。但这种情况下的异议提出需要满足一定的条件，并经过法院的审查批准。

法律建议：

• 作为被告，在收到起诉状副本后，应认真审查原告的主体资格，如发现原告主体不适格，应及时在答辩期间内提出异议，并准备充分的证据和理由支持其异议。
• 如果对原告主体资格的审查存在疑问或困难，建议咨询专业律师，以获取更准确的法律意见和帮助。

可能遇到的法律问题及应对：

• 如果被告未在答辩期间内提出异议，但在后续诉讼过程中才发现原告主体不适格，此时被告应尽快向法院说明情况，并申请追加或变更当事人，或者提出中止诉讼的申请。但需注意，这种情况下法院可能会对被告的异议进行更严格的审查。
• 如果被告提出的异议被法院驳回，被告应尊重法院的裁定，并考虑是否通过上诉等法律途径来维护自己的权益。