结论：协商好还本金但多扣了钱，一般情况下是可以要求退还的，但具体能否退还及退还方式需根据实际情况判断。
分析说明：
合同关系与还款约定：
- 在协商还款的过程中，双方通常会就还款金额、还款时间等关键条款达成一致，并形成书面的或口头的合同关系。如果多扣的钱并非双方协商一致的内容，那么这种多扣行为就可能构成违约。
- 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，合同双方应当按照约定履行自己的义务，不得擅自变更或者解除合同。因此，如果多扣了钱，且这一行为并非双方协商一致的结果，那么收款方有义务将多扣的部分退还给付款方。
退款的可能性与途径：
- 协商退款：首先，付款方可以尝试与收款方进行协商，说明多扣钱的情况，并要求收款方退还多扣的部分。如果收款方同意，那么双方可以签订一份退款协议，明确退款金额、退款时间等关键条款。
- 法律途径：如果协商无果，付款方可以考虑通过法律途径来维护自己的权益。例如，可以向法院提起诉讼，要求收款方退还多扣的钱，并可能要求收款方承担因违约而造成的损失。在诉讼过程中，付款方需要提供充分的证据来证明多扣钱的事实，以及双方之间的合同关系。
特殊情况考虑：
- 如果双方在协商还款时，对于还款金额、还款方式等存在模糊或不明确的地方，那么可能会导致对多扣钱的理解存在分歧。在这种情况下，双方需要仔细审查合同条款，或者寻求专业的法律意见来明确各自的权利和义务。
- 另外，如果多扣的钱是由于银行、支付机构等第三方的错误导致的，那么付款方可能需要先与这些第三方进行沟通，要求其纠正错误并退还多扣的钱。如果第三方拒绝退还，付款方可以考虑通过法律途径来维护自己的权益。
行动建议：
- 保留证据：首先，付款方需要保留好所有与还款相关的证据，如转账记录、聊天记录、合同文本等。这些证据将在后续的协商或法律诉讼中起到关键作用。
- 尝试协商：在保留好证据的基础上，付款方可以尝试与收款方进行协商，要求其退还多扣的钱。如果协商成功，双方可以签订退款协议并按照协议履行。
- 寻求法律帮助：如果协商无果，付款方可以考虑寻求专业的法律帮助。可以咨询律师，了解自己的权益和可能的法律途径，并根据律师的建议采取相应的行动。
后续思考依据：
- 在处理类似纠纷时，关键在于明确双方之间的合同关系以及各自的权利和义务。如果合同条款清晰明确，且多扣钱的行为并非双方协商一致的结果，那么付款方有权要求收款方退还多扣的部分。
- 如果合同条款存在模糊或不明确的地方，或者多扣钱的行为是由于第三方的错误导致的，那么处理起来可能会更加复杂。在这种情况下，付款方需要仔细审查合同条款，或者寻求专业的法律意见来明确自己的权益和可能的法律途径。
如有其他疑问，可以直接向我咨询。