您好，关于协商解除劳动合同补偿标准是否按实发工资计算的问题，我可以给您一个清晰、详细且深入的解答。
首先，我们需要明确的是，协商一致解除劳动合同时，赔偿金的计算基数通常是应发工资，而非实发工资。这一结论主要基于以下法律依据：
《中华人民共和国劳动合同法》第四十七条：该条款规定，经济补偿按劳动者在本单位工作的年限，每满一年支付一个月工资的标准向劳动者支付。这里的“月工资”指的是劳动者在劳动合同解除或者终止前十二个月的平均工资。
《中华人民共和国劳动合同法实施条例》第二十七条：该条款进一步明确，劳动合同法第四十七条规定的经济补偿的月工资按照劳动者应得工资计算，这包括计时工资或者计件工资以及奖金、津贴和补贴等货币性收入。
接下来，我们区分一下应发工资和实发工资的概念：
应发工资：这是用人单位依据国家有关规定或劳动合同的约定，以货币形式直接支付给本单位劳动者的劳动报酬。它一般包括计时工资、计件工资、奖金、津贴和补贴、加班加点工资以及特殊情况下支付的工资等。
实发工资：这是劳动者实际到手的金额，是扣除社保、公积金、个税等项目后的实际收入。
在协商解除劳动合同的情境下，赔偿金的计算基数应为劳动者在劳动合同解除或者终止前十二个月的平均应发工资。这是因为应发工资更能全面反映劳动者的收入水平，它包含了劳动者在正常工作时间内的劳动报酬以及可能获得的奖金、津贴和补贴等。
此外，协商解除劳动合同的补偿标准还受到以下因素的影响：
提出解除的一方：如果是用人单位提出协商解除，那么需要支付经济补偿；如果是劳动者提出，则一般情况下无需支付经济补偿，但存在例外情况，如用人单位存在违法违规行为导致劳动者提出解除。
劳动者的具体工作年限和月工资水平：经济补偿的金额与劳动者在本单位的工作年限以及月工资水平直接相关。
特殊情况：如果劳动者月工资高于所在地区上年度职工月平均工资的三倍，那么经济补偿标准将按职工月平均工资三倍的数额支付，且支付年限最高不超过十二年。
在实际操作中，双方应明确补偿的具体金额、支付方式及时间等，以避免后续纠纷。如果对补偿标准存在争议，劳动者可以通过劳动仲裁或诉讼等合法途径来维护自身权益。
希望以上解答能够帮助您更好地理解协商解除劳动合同的补偿标准问题。如果您还有其他疑问或需要进一步的帮助，请随时告诉我。