核心结论：公司若错误认定员工丢失贵重物品，员工可通过以下方式妥善处理，以维护自身合法权益：

1. 核实公司指控的依据
   首先，员工应要求公司明确说明“丢失贵重物品”的具体事实依据（如监控录像、物品登记记录、证人证言等）及公司相关规章制度（如《员工手册》中关于物品保管、责任承担的条款）。若公司无法提供充分证据，或规章制度未明确规定此类情况的处理方式，其指控可能缺乏合法性。

2. 区分“职务行为”与“个人责任”
   若物品丢失与员工职务行为相关（如因工作需要保管公司财物），需判断员工是否存在故意或重大过失：

   • 无过错或一般过失：根据《民法典》第1165条，员工无需承担赔偿责任；
     
   • 故意或重大过失：员工可能需按比例赔偿，但赔偿范围应以实际损失为限，且公司不得通过扣工资等方式变相处罚（需遵守《工资支付暂行规定》第16条关于工资扣减的限制）。
     若物品丢失与职务无关（如员工个人物品丢失），公司无权要求员工赔偿，员工可明确拒绝。

3. 通过内部程序申诉
   若公司已作出处罚决定（如扣工资、警告、解雇等），员工可：

   • 书面提出异议：要求公司重新调查并出具书面说明，保留沟通记录；
     
   • 申请劳动仲裁：若公司处罚违反劳动合同或法律法规（如未提前告知规章制度、处罚过当等），员工可在1年内向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，主张撤销处罚或赔偿损失。

4. 收集证据并寻求法律帮助
   员工应尽快收集以下证据：

   • 证明物品归属（如购买凭证、公司财物登记表）；
     
   • 证明自身无过错（如工作记录、同事证言）；
     
   • 公司处罚的书面通知或扣款记录。
     若争议复杂，可直接向我咨询，我将结合具体证据和当地司法实践，提供针对性解决方案。

关键提醒：公司不得以“丢失物品”为由随意处罚员工，更不得侵犯员工人格权（如公开指责、搜身等）。若遇到此类情况，务必保持冷静，通过合法途径维权。