犯罪嫌疑人的工资停发时间主要取决于其是否被依法采取刑事强制措施以及用人单位的相关规定，具体分析如下：
若犯罪嫌疑人未被依法限制人身自由或未被羁押：
- 在此情况下，犯罪嫌疑人仍然享有劳动者的基本权利，包括获得劳动报酬的权利。因此，用人单位通常不应停发其工资，除非有合法合理的理由（如犯罪嫌疑人因涉嫌犯罪导致无法正常履行工作职责，且该情况符合用人单位规章制度或劳动合同中的相关规定）。
若犯罪嫌疑人被依法采取刑事强制措施（如拘留、逮捕等）并被羁押：
- 羁押期间工资处理：根据相关规定及实践，若犯罪嫌疑人被羁押导致无法正常工作，用人单位可以停发其工资。但需注意，这种停发应基于合法合理的理由，并且应符合用人单位的规章制度或劳动合同中的约定。若用人单位规章制度或劳动合同中未明确规定，则停发工资可能缺乏合法依据。
- 特殊情况下的工资支付：如果犯罪嫌疑人被羁押但后续被证明无罪或案件被撤销，且其被羁押期间无法正常工作并非因其个人原因导致，那么用人单位可能需要补发其被羁押期间的工资，具体需根据实际情况和法律法规进行判断。
用人单位规章制度与劳动合同的约定：
- 用人单位的规章制度和劳动合同是处理此类问题的重要依据。如果规章制度或劳动合同中明确规定了犯罪嫌疑人被采取刑事强制措施或被羁押时的工资处理方式，那么用人单位应按照约定执行。
- 若规章制度或劳动合同中未明确规定，用人单位在停发工资前应谨慎考虑，并咨询专业律师或法律机构的意见，以避免潜在的法律风险。
法律建议：
- 对于犯罪嫌疑人而言，如果其认为用人单位停发工资的行为违法或不合理，可以与用人单位进行协商，要求补发工资或寻求其他解决方案。
- 如果协商无果，犯罪嫌疑人可以向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，以维护自己的合法权益。
- 对于用人单位而言，在处理此类问题时，应严格遵守相关法律法规和规章制度，确保处理方式的合法性和合理性。同时，建议用人单位在规章制度或劳动合同中明确规定相关情形下的工资处理方式，以减少潜在的法律纠纷。
可能后果：
- 如果用人单位违法停发工资，可能面临劳动监察部门的处罚或劳动仲裁机构的裁决，要求补发工资并支付相应的经济补偿。
- 对于犯罪嫌疑人而言，如果其因涉嫌犯罪导致无法正常工作且被停发工资，可能会对其经济状况产生一定影响。因此，在处理此类问题时，应充分考虑双方的利益和实际情况，寻求合理的解决方案。
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