结论：在对方持刀上门行凶的情况下，您将其打成轻微伤，是否需要赔偿医药费，需结合具体情况判断，一般无需赔偿，但若防卫行为超出必要限度，则可能需承担部分赔偿责任。以下从不同角度为您详细分析：
一、正当防卫角度
正当防卫的构成：
- 根据《中华人民共和国刑法》第二十条，正当防卫是指为了使国家、公共利益、本人或者他人的人身、财产和其他权利免受正在进行的不法侵害，而采取的制止不法侵害的行为。在对方持刀上门行凶的紧急情况下，您有权采取必要的防卫措施以保护自身安全。
防卫限度的判断：
- 正当防卫的限度要求防卫行为必须与不法侵害的强度、手段相适应，不能明显超过必要限度造成重大损害。若您在防卫过程中，仅使用必要的力量将对方打成轻微伤，且该伤害程度与对方持刀行凶的威胁程度相适应，则您的行为属于正当防卫，无需承担赔偿责任。
二、防卫过当角度
防卫过当的认定：
- 若您的防卫行为明显超过必要限度，例如在对方已失去侵害能力或已停止侵害行为后，仍继续对其实施暴力，导致对方轻微伤以外的更严重伤害，则可能构成防卫过当。
防卫过当的责任：
- 根据《中华人民共和国刑法》第二十条第二款，防卫过当应当负刑事责任，但是应当减轻或者免除处罚。在民事赔偿方面，防卫过当者需对超出必要限度的损害部分承担赔偿责任。因此，若您的防卫行为被认定为防卫过当，且对方轻微伤中的部分或全部伤害被认定为超出必要限度，则您可能需要承担部分医药费赔偿责任。
三、民事赔偿角度
民事赔偿的请求权基础：
- 根据《中华人民共和国民法典》侵权责任编，行为人因过错侵害他人民事权益造成损害的，应当承担侵权责任。但在正当防卫的情况下，防卫人无需承担赔偿责任。
赔偿范围的确定：
- 若您的防卫行为被认定为正当防卫，则无需赔偿对方任何费用，包括医药费。若被认定为防卫过当，则赔偿范围通常限于超出必要限度的损害部分，即对方轻微伤中可能被认定为超出必要限度的部分医药费。
四、实际操作建议
及时报警并保留证据：
- 在发生此类事件后，应立即报警并保留相关证据，如现场照片、视频、证人证言等，以便后续证明您的防卫行为属于正当防卫或防卫过当的程度。
咨询专业律师：
- 由于此类案件涉及刑事和民事责任的复杂交织，建议您在报警后尽快咨询专业律师，以便更准确地评估您的法律责任和制定应对策略。不过，现在您就可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供更详细的法律建议。
总结：在对方持刀上门行凶的情况下，您将其打成轻微伤是否需要赔偿医药费，取决于您的防卫行为是否属于正当防卫以及是否超出必要限度。若属于正当防卫且未超出必要限度，则无需赔偿；若构成防卫过当，则可能需承担部分赔偿责任。因此，建议您在报警后尽快咨询专业律师以获取更准确的法律评估和建议。