公司对公司的合同，只盖章在一般情况下是有效的，但具体效力需结合实际情况判断。以下是对此问题的详细分析：
一、盖章的法律意义
印章的法定性：根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，当事人采用合同书形式订立合同的，自当事人均签名、盖章或者按指印时合同成立。在合同上加盖公章是表明合同内容为签订方的真实意思表示的重要方式之一。公章作为公司或组织的法定代表标志，具有法律效力，其加盖行为通常被视为公司对合同内容的认可和承诺。
印章的证明力：印章在合同签订中具有证明合同效力和约束双方履行合同义务的作用。它代表了法人对合同内容的确认，是合同成立和生效的重要标志。
二、只盖章的有效性条件
合同内容合法：合同的内容必须符合国家法律法规的规定，不得违反公序良俗或损害国家、集体或第三人的利益。这是合同有效性的基础。
双方意思表示真实：合同的签订必须是双方自愿、平等、协商一致的结果，不存在欺诈、胁迫等情形。如果合同是在一方受欺诈或胁迫的情况下签订的，那么该合同可能无效或可撤销。
具备合同要素：合同应包含当事人的名称或姓名、标的、数量、质量、价款或报酬、履行期限、地点和方式、违约责任等基本条款。这些要素是合同成立和生效的必要条件。
三、特殊情况下的有效性考量
合同特别约定：如果合同中明确约定了生效条件，如必须由法定代表人签字或其他特定形式才能生效，那么仅盖公章可能并不足以使合同有效。此时，需满足合同约定的生效条件，合同才能产生法律效力。
公章真实性：如果公章是伪造的或存在其他违法行为，那么合同的效力也会受到影响。因此，在签订合同时，应确保公章的真实性，以避免潜在的法律风险。为了防范伪造公章的风险，可以在合同中约定使用防伪公章或采用其他验证方式。
相对方有理由相信行为人有代理权：如果盖章之人虽无代理权，但相对方有理由相信其有代理权（如表见代理），则该盖章行为仍然有效，合同对公司产生约束力。这种情况下，公司可能需要承担表见代理的法律后果。
电子印章的使用：随着科技的发展，电子印章也逐渐被广泛应用于合同签订中。根据《中华人民共和国电子签名法》，可靠的电子签名与手写签名或盖章具有同等的法律效力。因此，在符合法律规定的条件下，使用电子印章签订的合同同样具有法律效力。但需要注意的是，电子印章的使用需满足一定的技术条件和安全要求。
四、建议与注意事项
使用公章：在签订合同时，应加盖公司的法定公章或合同专用章，且印章应经过合法的备案程序。避免使用未经备案或伪造的公章。
盖章清晰完整：印章需盖在合同约定的盖章位置，确保盖章清晰、完整，不得模糊、残缺或偏移。若盖章不清晰，可能导致合同的效力存在争议，需重新盖章确认。
结合签字确认：为避免日后可能出现关于盖章真实性、盖章权限等方面的争议，建议结合法定代表人或授权代表的签字等其他确认方式，进一步强化合同的效力和证明力。
审查合同条款：在签订合同时，除了关注盖章的合法性外，还应仔细审查合同的其他条款和内容，确保合同内容合法、明确、完整。避免签订存在漏洞或歧义的合同。
保留证据：在签订和履行合同过程中，应妥善保留好相关证据和文件，如合同原件、盖章记录、履行凭证等。这些证据和文件在发生争议时将有助于维护自己的合法权益。
综上所述，公司对公司的合同只盖章在一般情况下是有效的，但具体效力需结合合同内容、双方意思表示、合同要素以及特殊情况下的有效性考量等因素来综合判断。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。