核心结论：罚款通知单的盖章主体取决于双方合同约定及实际交易习惯，通常由主张罚款的一方盖章后送达对方。以下是具体分析：

1. 合同有明确约定时
   若双方签订的合同中已约定“罚款通知单需由甲方（客户）盖章后生效”或“需由乙方（贵司）盖章确认”，则应严格按合同执行。例如：

   • 若合同约定“客户有权对延迟交货处以罚款，罚款通知单需客户盖章后送达供应商”，则盖章主体为客户；
     
   • 若合同约定“供应商需对质量问题承担罚款责任，罚款通知单由供应商盖章确认”，则盖章主体为贵司。
     法律依据：根据《民法典》第465条，合同对双方具有法律约束力，有约定的从约定。

2. 合同无明确约定时
   若合同未约定盖章主体，需结合交易习惯和罚款性质判断：

   • 客户主张罚款：通常由客户制作并盖章通知单，作为其主张权利的凭证（如因贵司违约导致客户损失，客户需通过盖章文件固定索赔依据）；
     
   • 贵司自认罚款：若贵司认可自身责任并同意罚款，可由贵司盖章确认（如内部质检发现瑕疵后主动处罚）。
     实践建议：无论哪方盖章，通知单需明确罚款原因、金额、计算依据及支付期限，避免因内容模糊引发争议。

3. 风险提示与建议

   • 客户盖章的风险：若客户单方盖章通知单，可能被认定为“单方变更合同”（如合同未约定罚款条款），贵司可主张无效；但若贵司已实际履行（如支付罚款），可能被推定为认可变更。
     
   • 贵司盖章的风险：若贵司在未核实责任的情况下盖章确认罚款，可能构成对违约事实的自认，后续难以推翻。
     建议操作：
     
   • 收到客户盖章的通知单后，先审查合同依据及事实合理性，再决定是否支付；
     
   • 若需贵司盖章，建议附加说明（如“本通知单仅确认罚款金额，不视为对违约责任的最终认定”）。

总结：盖章主体需以合同约定为准，无约定时由主张罚款的一方盖章更符合逻辑。若对通知单内容或法律后果有疑问，可进一步提供具体条款或事实，我将为您分析风险点。