结论：将本应上交公司的款项因经济纠纷进行扣押，是否构成挪用资金罪，需根据具体情况判断，不能一概而论。以下从不同角度进行分析：

1. 挪用资金罪的构成要件：

   • 主体要件：挪用资金罪的主体是公司、企业或者其他单位的工作人员，但国有公司、企业或者其他国有单位中从事公务的人员和国有公司、企业或者其他国有单位委派到非国有公司、企业以及其他单位从事公务的人员除外。
   • 主观要件：行为人必须具有非法占有或挪用资金的目的，即明知自己的行为是挪用资金，仍故意为之。
   • 客观要件：行为人实施了挪用资金的行为，即未经合法批准，擅自将公司资金挪作他用，且数额较大、超过三个月未还，或者虽未超过三个月，但数额较大、进行营利活动，或者进行非法活动。
   • 客体要件：挪用资金罪侵犯的客体是公司、企业或者其他单位的资金使用权。

2. 因经济纠纷扣押款项的性质：

   • 如果扣押款项的行为是基于合法的经济纠纷，且行为人主观上并无非法占有或挪用资金的目的，而是希望通过扣押款项来保障自己的合法权益，那么这种行为通常不构成挪用资金罪。
   • 然而，如果行为人利用职务上的便利，以经济纠纷为借口，擅自将公司资金挪作他用，且数额较大、超过三个月未还，或者虽未超过三个月，但数额较大、进行营利活动，或者进行非法活动，那么这种行为就可能构成挪用资金罪。

3. 具体案例分析：

   • 假设某公司员工因与公司存在经济纠纷，擅自将公司的一笔款项扣押，并用于个人消费或投资其他项目，且数额较大、超过三个月未还。在这种情况下，该员工的行为就可能构成挪用资金罪，因为他利用了职务上的便利，擅自挪用了公司资金，且主观上具有非法占有的目的。
   • 另一方面，如果某公司员工因与公司存在经济纠纷，扣押了公司的一笔款项，但并未挪作他用，而是等待纠纷解决后归还公司。在这种情况下，该员工的行为通常不构成挪用资金罪，因为他并未擅自挪用公司资金，也没有非法占有的目的。

4. 法律建议：

   • 如果您或您所在的公司遇到类似情况，建议首先通过合法途径解决经济纠纷，如协商、调解、仲裁或诉讼等。
   • 在解决纠纷的过程中，应确保不擅自挪用公司资金，以免触犯法律。
   • 如果您对具体情况是否构成挪用资金罪存在疑问，建议及时咨询专业律师，以便得到准确的法律意见和帮助。

总结：将本应上交公司的款项因经济纠纷进行扣押，是否构成挪用资金罪，需根据具体情况判断。关键在于行为人是否具有非法占有或挪用资金的目的，以及是否实施了挪用资金的行为。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。