结论：没有水路运输许可证的合同是否有效，需根据具体情况综合判断，但通常情况下，未取得水路运输经营资质的承运人签订的合同，人民法院会倾向于认定合同无效。以下从多个角度进行详细分析：

一、法律依据与合同效力判断原则

1. 法律依据：

   • 根据《中华人民共和国民法典》第一百五十三条，违反法律、行政法规的强制性规定的民事法律行为无效，但是，该强制性规定不导致该民事法律行为无效的除外。
   • 水路运输方面，根据《中华人民共和国水路运输管理条例》，从事国内水路运输需取得相应经营资质。

2. 合同效力判断原则：

   • 合同的有效性主要取决于行为人是否具有相应的民事行为能力、意思表示是否真实、是否违反法律强制性规定以及是否违背公序良俗。
   • 对于特定运输方式（如水路运输），未取得相应许可将直接影响合同的效力，因为这涉及到公共安全和运输市场秩序。

二、水路运输合同的具体分析

1. 水路运输的特殊性：

   • 水路运输涉及公共安全、环境保护等多方面因素，因此法律对水路运输经营者的资质有严格要求。
   • 未取得水路运输经营资质的承运人，其运输行为可能被视为非法运营，从而影响合同的效力。

2. 司法实践中的倾向：

   • 在司法实践中，对于未取得水路运输经营资质而签订的运输合同，人民法院通常会倾向于认定合同无效。这是因为此类合同违反了法律的强制性规定，且可能损害公共利益。

三、合同有效性的其他考量因素

1. 行为能力与意思表示：

   • 即使承运人未取得水路运输经营资质，但如果合同双方具备完全民事行为能力，且意思表示真实，不存在欺诈、胁迫或重大误解，这仍然是判断合同效力的基础因素。

2. 实际履行与违约责任：

   • 如果合同履行必须以取得水路运输许可为前提，而承运人未取得许可导致合同无法履行，承运人可能需承担违约责任。但这一责任的存在并不影响合同因违反法律强制性规定而无效的事实。

四、建议与风险提示

1. 签订合同前的准备：

   • 在签订水路运输合同时，双方应充分了解相关法律法规和具体运输方式的要求，确保承运人具备相应的经营资质。

2. 合同履行中的风险：

   • 如果承运人未取得水路运输经营资质，双方应谨慎考虑是否继续履行合同，并评估可能面临的法律风险。

3. 法律咨询的重要性：

   • 由于水路运输合同的效力判断涉及复杂的法律问题，建议在合同签订前进行详细的法律咨询，以确保合同的合法性和有效性。

总结：没有水路运输许可证的合同在通常情况下会被认定为无效，因为这违反了法律的强制性规定并可能损害公共利益。然而，具体案件的判决还需考虑合同双方的行为能力、意思表示真实性以及其他相关因素。因此，在签订和履行水路运输合同时，务必确保承运人具备相应的经营资质，并咨询专业律师以降低潜在的法律风险。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。