针对您提出的“单位建房把附近几辈人使用的水井填了如何处理”的问题，这确实是一个涉及水资源管理和居民权益的重要事项。以下是我根据相关法律法规和典型案例，为您提供的详细解答：

一、水井的法律属性与保护

首先，需要明确的是，无论水井是公有还是个人投建，它们都是重要的水资源设施，受到法律的保护。特别是那些长期被附近居民使用的水井，往往承载着一定的历史和文化价值，其填埋或处置需遵循严格的法律程序。

二、单位填埋水井的合法性评估

1. 是否经过批准：单位在填埋水井前，必须获得相关水行政主管部门的批准。未经批准擅自填埋水井，可能构成违法行为，将受到法律的制裁。

2. 是否考虑居民用水需求：在填埋水井前，单位应充分考虑附近居民的用水需求，并采取相应的替代措施，如接入市政供水系统或建设新的供水设施，以确保居民用水不受影响。

三、处理建议

1. 与单位协商：

   • 首先，您可以尝试与填埋水井的单位进行协商，了解其填埋水井的原因和目的，以及是否考虑了居民的用水需求。
   • 如果单位未经过批准擅自填埋水井，您可以要求其恢复水井或提供替代的供水方案。

2. 向水行政主管部门投诉：

   • 如果协商无果，您可以向当地的水行政主管部门（如水利局）投诉，反映单位擅自填埋水井的情况。
   • 水行政主管部门将依法进行调查，并根据调查结果采取相应的法律措施，如责令单位恢复水井、罚款等。

3. 寻求法律援助：

   • 如果您的权益受到严重侵害，且无法通过协商或投诉解决，您可以考虑寻求法律援助，通过法律途径维护自己的合法权益。

四、典型案例参考

在昌吉州水利局公布的水行政执法典型案例中，有多起涉及未经批准擅自取水或凿井的案件。这些案例表明，对于未经批准擅自处置水资源设施的行为，水行政主管部门将依法进行严厉打击和处罚。因此，单位在填埋水井前，必须确保获得相关批准，并充分考虑居民的用水需求。

五、总结与建议

单位建房填埋附近居民长期使用的水井是一个复杂而敏感的问题，需要综合考虑法律、居民权益和水资源保护等多方面因素。我建议您首先与单位进行协商，了解其填埋水井的原因和目的，并要求其提供替代的供水方案。如果协商无果，您可以向当地的水行政主管部门投诉，并寻求法律援助以维护自己的合法权益。同时，也希望单位在未来的建设活动中，能够更加注重保护水资源和居民权益，实现可持续发展。