公司有一笔资金不知去向，并不一定会直接算到股东头上。这需要根据具体情况来分析，以下是从不同角度给出的详细解答：

1. 公司财产与股东财产的独立性

   • 在法律上，公司是一个独立的法人实体，拥有自己的财产权。股东作为公司的投资者，其出资构成公司的资本，但股东的个人财产与公司财产是分开的。因此，单纯因为公司资金不知去向，并不能直接将责任归咎于股东。

2. 股东的责任范围

   • 股东的责任通常限于其出资额或认购的股份。在公司正常运营过程中，股东不直接参与公司的日常管理，除非他们同时担任公司的高级管理人员或董事等职务。因此，除非股东存在滥用公司法人独立地位、逃避债务等违法行为，否则他们通常不对公司资金的流失承担直接责任。

3. 可能涉及股东责任的情况

   • 如果股东同时担任公司的高级管理人员或董事，且因他们的故意或重大过失导致公司资金流失，那么他们可能需要承担相应的赔偿责任。
   • 如果股东存在抽逃出资、虚假出资等违法行为，导致公司资本不实，进而影响公司的偿债能力，那么他们也可能需要承担法律责任。
   • 在某些极端情况下，如果股东利用公司作为逃避债务的工具，严重损害公司债权人的利益，法院可能会“揭开公司面纱”，直接追究股东的责任。

4. 公司资金流失的调查与处理

   • 当公司发现资金流失时，应首先进行内部调查，查明资金流失的原因和责任人。
   • 如果调查发现存在违法行为或内部管理漏洞，公司应及时采取措施予以纠正，并考虑向相关部门报案或提起诉讼。
   • 在处理过程中，公司应保留好相关证据，以便在必要时追究相关责任人的法律责任。

5. 法律建议

   • 对于公司而言，应建立健全的财务管理制度，加强内部监督和控制，防止资金流失。
   • 对于股东而言，应了解自己的权利和义务，避免滥用公司法人独立地位或逃避债务等行为。
   • 如果公司资金流失问题复杂或涉及金额较大，建议及时咨询专业律师，以便更好地维护自身权益。

总结来说，公司资金不知去向并不一定会直接算到股东头上。这需要根据具体情况来分析股东的责任范围以及是否存在违法行为等因素。如果公司或股东面临此类问题，建议及时咨询专业律师以获取更具体的法律建议。