核心结论：被批捕后又有民事纠纷案件，最后合并案件的处理方式需根据案件性质和关联性来决定，以下是具体分析：

1. 案件性质与关联性判断

   • 刑事附带民事诉讼：如果民事纠纷与批捕的刑事案件存在直接关联，例如因犯罪行为导致的财产损失、人身伤害等，那么该民事纠纷可以作为刑事附带民事诉讼处理。这意味着在刑事诉讼过程中，被害人可以同时提起民事赔偿请求，法院会一并审理并作出判决。这种方式的好处在于可以节省诉讼时间和成本，提高诉讼效率。
   • 独立民事诉讼：如果民事纠纷与刑事案件无直接关联，或者虽然有关联但被害人选择不提起刑事附带民事诉讼，那么该民事纠纷将作为独立的民事诉讼案件处理。此时，民事案件的审理将不受刑事案件的影响，双方当事人需按照民事诉讼程序进行举证、质证和辩论。

2. 合并审理的可能性与条件

   • 合并审理的条件：在特定情况下，如果民事纠纷与刑事案件存在紧密的关联性，且为了查明事实、提高诉讼效率，法院可能会考虑将两者合并审理。但合并审理需要满足一定的条件，如案件事实相互交织、证据相互印证等。
   • 合并审理的程序：如果法院决定合并审理，通常会先审理刑事案件，再根据刑事案件的审理结果来审理民事案件。在合并审理过程中，法院会综合考虑刑事和民事两个方面的证据和事实，作出公正的判决。

3. 实际操作中的建议

   • 及时沟通：作为被告人或被害人，应及时与法院沟通，了解案件进展和合并审理的可能性。如果希望合并审理，应向法院提出书面申请，并说明合并审理的理由和依据。
   • 准备充分：无论是作为刑事案件的被告人还是民事案件的当事人，都应准备充分的证据和材料，以支持自己的主张。在合并审理的情况下，更需注意证据的完整性和关联性。
   • 寻求专业帮助：由于刑事和民事诉讼程序存在差异，且合并审理的情况较为复杂，因此建议寻求专业律师的帮助。律师可以提供专业的法律意见和诉讼策略，帮助当事人更好地维护自己的合法权益。

总结与引导：被批捕后又有民事纠纷案件，最后是否合并案件需根据具体情况来判断。如果你正面临这样的情况，或者有任何法律疑问，都可以直接向我咨询。我会根据你的具体情况，提供清晰、详细、有深度的法律解答。