工程收取保证金是否违法，需根据具体情况判断。以下从合法与违法两种情况，为你详细分析：

合法收取保证金的情况

1. 投标保证金

   • 目的：保护招标人免受投标人不当行为导致的损失，比如投标人在投标有效期内随意撤回投标文件，或者中标后无正当理由不与招标人订立合同等。
   • 法律依据：招标文件中有明确要求，且遵循相关法律法规规定的程序和要求。例如《招标投标法实施条例》规定，招标人在招标文件中要求投标人提交投标保证金的，投标保证金不得超过招标项目估算价的2%。
   • 管理要求：需按照法律法规规定的程序进行收取、管理和退还。一般情况下，投标保证金由招标人或其委托的招标代理机构负责收取和管理，在确定中标人后，未中标的投标人的投标保证金应尽快退还。
   • 举例：某建筑工程招标，招标文件规定投标保证金为项目估算价1.5%，投标人A按照要求缴纳了保证金并参与投标，最终未中标，招标人在规定时间内将保证金退还给了A。这种情况下的保证金收取就是合法的。

2. 履约保证金

   • 目的：确保承包方按合同约定履行义务，如按时完成工程、保证工程质量等。
   • 合法性：需在合同条款中事先约定，并遵循相关法律法规。例如，发包方和承包方在建设工程合同中明确约定，承包方需缴纳一定比例的履约保证金，若承包方违约，发包方有权扣除相应保证金。
   • 举例：甲乙双方签订了一份桥梁建设合同，合同约定乙方需缴纳合同总价5%的履约保证金。在施工过程中，乙方因自身原因导致工程进度严重滞后，甲方按照合同约定扣除了一部分履约保证金作为违约赔偿，这种保证金的收取和处理是合法的。

3. 农民工工资保证金

   • 目的：保障农民工工资支付，防止拖欠。这是为了维护农民工的合法权益，确保他们能够按时拿到劳动报酬。
   • 合法性：依据相关政策法规设立，用于特定情况下的工资支付保障。例如，一些地方政府规定，建设单位在开工前需按照一定比例缴纳农民工工资保证金，若发生拖欠农民工工资的情况，可从该保证金中支付。
   • 举例：某房地产项目开工前，建设单位按照当地规定缴纳了农民工工资保证金。在项目建设过程中，施工单位拖欠了农民工工资，劳动保障部门从建设单位缴纳的保证金中支付了农民工工资，之后建设单位再按照规定补足保证金，这种操作是合法的。

违法收取保证金的情况

1. 无法定依据或合同约定

   • 任何一方在无法律明确规定或合同条款约定的情况下，擅自要求对方缴纳保证金，均属违法行为。例如，工程发包方随意要求承包方缴纳“工程信誉保证金”，但没有任何法律法规或合同依据支持这种收取行为。
   • 举例：丙公司作为发包方，在与丁公司签订建设工程合同后，又额外要求丁公司缴纳一笔“工程信誉保证金”，否则就不让丁公司进场施工，而合同中并没有关于这笔保证金的约定，这种要求就是违法的。

2. 收取主体不合法

   • 投标保证金应由招标人或其委托的招标代理机构负责收取和管理。若由不具备相应资格的第三方（如个人、与招标活动无关的企业）收取，则构成违法。
   • 举例：在某工程招标过程中，招标人委托了专业的招标代理机构进行招标工作，但有一个与招标活动无关的个人声称可以帮忙收取投标保证金，并承诺给予一定的好处，若投标人向这个个人缴纳了保证金，这种收取行为就是违法的。

3. 违反保证金退还规定

   • 在工程结束后或满足合同约定的退还条件后，收取方故意拖延、拒绝退还保证金，属于违法行为。例如，中标人按规定签订合同并履行相关义务后，招标人未按时退还投标保证金。
   • 举例：戊公司中标了一个工程项目，按照招标文件要求缴纳了投标保证金，并签订了合同，在合同履行完毕后，招标人却以各种理由拖延退还投标保证金，这种行为就是违法的。

4. 其他名目或方式不当的保证金

   • 以其他非法定或合同约定的名目收取保证金，或收取方式、金额不符合规定，均可能构成违法，甚至犯罪。比如，以“安全保证金”的名目收取过高的费用，且没有合理的计算依据。
   • 举例：己公司作为发包方，要求承包方缴纳“安全保证金”，金额高达合同总价的20%，远远超过了合理的范围，且没有任何法律法规或合同依据支持这种高额收取行为，这种做法就是违法的。

建议：在实际操作中，各方应谨慎处理保证金问题，确保收取、管理和退还的合法性，以保障各方的合法权益。如遇违法收取保证金的情况，应及时收集相关证据，如合同、缴费凭证、沟通记录等，向我咨询具体的维权措施。