针对您提出的“行政处罚超期三年怎么处理”的问题，首先需要明确的是，“行政处罚超期三年”这一表述可能涉及多个方面，包括行政机关办案超期、当事人相关期限超期，以及行政处罚的追究时效等。下面我将结合相关法律法规，为您详细分析并解答。
一、行政机关办案超期
法律规定：
- 根据《行政处罚法》等法律法规，行政机关在办理行政处罚案件时，有明确的期限要求，旨在确保高效办案和保障当事人权益。
处理方式：
- 若行政机关办案超期，上级机关或内部法制部门应责令承办部门说明情况，并督促尽快结案。
- 若因超期给当事人造成损害，当事人有权申诉、控告，并要求行政机关承担相应责任，包括适当补偿。
- 在行政复议或行政诉讼中，超期办案可能影响行政处罚程序的合法性，复议机关或人民法院可能因此撤销行政处罚决定。
特殊情况：
- 如确因特殊情况（如案件复杂、证据收集困难等）无法及时结案，行政机关应向上级机关报告并说明理由，同时告知当事人案件进展情况。但这种情况并不改变超期的事实，只是提供了合理的解释。
二、当事人相关期限超期
申请听证超期：
- 当事人未在规定期限内申请听证，通常视为放弃权利，行政机关将继续推进案件。
- 若因不可抗力或其他不可预见、不可避免的情况导致超期，当事人应及时向行政机关说明并提供证明材料，行政机关可酌情决定是否准许听证申请。
履行处罚决定超期：
- 当事人无正当理由逾期不履行行政处罚决定，行政机关可依法加处罚款或滞纳金。
- 经催告仍不履行，行政机关可依法申请人民法院强制执行，但需在被执行人的法定起诉期限届满之日起180日内提出。
三、行政处罚的追究时效
一般规定：
- 根据《行政处罚法》，违法行为在二年内未被发现的，不再给予行政处罚。这一时效从违法行为发生之日起计算；若违法行为有连续或继续状态，则从行为终了之日起计算。
特殊规定：
- 对于涉及公民生命健康安全、金融安全且有危害后果的特殊违法行为，上述二年的追究时效延长至五年。
- 若法律另有特别规定（如治安管理领域可能为六个月），则依其规定执行。
关于“三年”的误解：
- “行政处罚有效期三年”并非准确表述。行政处罚的追究时效、记录保存期限及公示期限均受具体法律规定和违法情形的制约，并非统一为三年。
- 行政处罚记录的保存期限因案件性质和处理程序的不同而有所差异，简易程序处理的案件记录通常保存三年，但一般程序处理的案件记录保存五年，重大或特殊案件可能更长。
- 市场监督管理部门行政处罚信息的公示期限目前拟规定为自公示之日起三年，但此前根据相关规定，一般程序作出的行政处罚决定相关信息的公示期限为五年。公示期限并不等同于行政处罚的有效期或追究时效。
四、总结与建议
- 对于行政机关办案超期，应加强内部管理，确保高效办案，并保障当事人权益。
- 对于当事人相关期限超期，应了解自己的权利和义务，及时行使权利并履行义务。
- 在处理行政处罚相关事务时，应仔细查阅相关法律法规，确保准确理解和应用各项规定。
- 若面临超期情况，双方应依法依规妥善处理，以维护行政处罚的合法性和公正性。
综上所述，行政处罚超期三年的处理需根据具体情况综合判断，包括超期原因、法律规定及当事人权益等。希望以上解答能对您有所帮助。如有其他疑问，请随时咨询。