针对您提出的“事实不清证据不足的刑事案件如何处理”的问题，以下是我为您提供的清晰、详细且有深度的解答：

一、公安机关的处理方式

当刑事案件遇到事实不清、证据不足的情况时，公安机关通常会采取以下措施：

1. 进一步补充侦查：

   • 公安机关会借助重新调查、收集证据等方式，力求保证证据的完整性和真实性。这包括重新询问证人、调取新的物证、进行技术鉴定等，以尽可能还原案件真相。

2. 撤销案件：

   • 若经过补充侦查后，证据仍然不足以达到起诉标准，公安机关会依法决定撤销案件。这意味着该刑事案件不再继续推进，犯罪嫌疑人会被立即释放，并发给释放证明。同时，公安机关会通知原批准逮捕的人民检察院。

二、检察机关的处理方式

在刑事案件中，若证据不足，检察机关也会根据案件的不同阶段作出相应决定：

1. 审查逮捕阶段：

   • 若现有证据不能证明有犯罪事实或犯罪嫌疑人可能实施犯罪，检察机关会作出不批准逮捕的决定。

2. 审查起诉阶段：

   • 对于公安机关移送起诉的案件，检察机关会进行细致审查。若认为证据不足，可退回公安机关补充侦查，也可自行侦查。补充侦查以二次为限，每次期限为一个月。
   • 经过二次补充侦查后，若证据仍然不足，不符合起诉条件，检察机关会依法作出不起诉决定。这意味着犯罪嫌疑人无需承担刑事责任，但可能面临其他非刑事处罚。

三、无罪推定原则的应用

在审理涉及事实不清、证据不足的案件时，应始终坚持贯彻无罪推定原则。即对于事实未明了或证据无法证明违法行为系犯罪嫌疑人所实施的情况，均需判定其为无罪。这是保障人权、维护司法公正的重要原则。

四、总结

综上所述，对于事实不清、证据不足的刑事案件，公安机关会进行进一步的补充侦查，并依法根据侦查结果作出撤销案件或继续侦查的决定。检察机关则会在审查逮捕和审查起诉阶段对证据进行严格把关，确保案件的合法性和公正性。在整个过程中，必须严格依照法定程序和证据规则进行操作，以保障处理结果的合法性和公正性。同时，无罪推定原则的应用也是确保司法公正和人权保障的重要一环。