劳动者对单位申请的工伤认定不服的，职工确实可以依法提起诉讼以维护自身权益。以下是对此问题的详细分析：
一、法律依据
根据《工伤保险条例》第五十五条的规定，有下列情形之一的，有关单位或者个人可以依法申请行政复议，也可以依法向人民法院提起行政诉讼：
- 申请工伤认定的职工或者其近亲属、该职工所在单位对工伤认定申请不予受理的决定不服的；
- 申请工伤认定的职工或者其近亲属、该职工所在单位对工伤认定结论不服的。
这一条款明确赋予了职工对工伤认定结论不服时提起诉讼的权利。
二、诉讼程序
行政复议前置（可选）：
- 在某些地区或特定情况下，职工在提起行政诉讼前可能需要先经过行政复议程序。但根据最新的法律规定和实践，并非所有情况下都需要复议前置，具体需根据当地规定和案件情况确定。
- 如果选择行政复议，职工应在收到工伤认定决定书之日起60日内，向作出决定的劳动行政部门的上一级行政机关提出复议申请。
行政诉讼：
- 如果对复议结果不满，或者选择不经过复议直接提起诉讼，职工应在收到工伤认定决定书或复议决定书之日起的法定期限内（一般为15日，但具体期限可能因地区而异），向人民法院提起行政诉讼。
- 在诉讼过程中，职工需要承担举证责任，提供充分的证据来支持自己的主张，如医疗记录、事故报告、目击者证言等。
- 法院将全面审查工伤认定的事实依据、法律适用以及程序合法性，并作出最终判决。
三、注意事项
时效限制：
- 行政诉讼和行政复议均受到严格的时效限制。职工必须密切关注并严格遵守相关的时间节点，以免因超过时效而丧失诉讼权利。
证据准备：
- 在提起诉讼前，职工应当尽可能收集并整理所有与工伤事实相关的证据材料。这些证据将在诉讼中起到至关重要的作用，有助于支持职工的主张并争取到应有的工伤保险待遇。
法律程序遵循：
- 职工在提起诉讼前应充分了解并遵循相关的法律程序，确保自己的诉讼行为合法有效。如有需要，可以寻求专业法律人士的帮助和指导。
四、法律后果
- 如果职工的诉讼请求得到法院的支持，法院将撤销或变更原工伤认定决定，并可能责令相关部门重新作出工伤认定。
- 如果职工的诉讼请求未得到法院的支持，法院将维持原工伤认定决定，职工需要接受并承担相应的法律后果。
总结来说，劳动者对单位申请的工伤认定不服时，完全有权选择通过法律途径来维护自己的合法权益。通过了解并遵循正确的诉讼程序和注意事项，职工可以更有效地挑战不公正的工伤认定决定，并争取到应有的工伤保险待遇。如有任何疑问或需要进一步的帮助，请直接向我咨询。