核心结论：两人合伙亏损时一方继续经营、一方退股的分配方式需根据合伙协议约定、法律规定及实际情况综合确定，主要涉及退股方能否取回出资、亏损分担比例、继续经营方是否需补偿等问题。以下分情况说明：

1. 若合伙协议有明确约定

• 分配规则：优先按协议约定处理。例如协议约定“亏损时退股方仅能取回剩余财产的50%”，或“继续经营方需按退股方出资比例补偿”，则按约定执行。
• 例外情形：若协议条款显失公平（如退股方需承担全部亏损），可能因违反《民法典》第151条被撤销或调整，但需退股方举证证明存在欺诈、胁迫等情形。

2. 若合伙协议无约定或约定不明

• 亏损分担原则：根据《合伙企业法》第33条，合伙企业的亏损由合伙人按照实缴出资比例分担；无法确定出资比例的，由合伙人平均分担。
  示例：若甲出资60%、乙出资40%，亏损100万元，则甲承担60万、乙承担40万。退股时，需先清偿债务，剩余财产按此比例分配。
• 退股方能否取回出资：
  
  • 若合伙财产不足清偿债务：退股方需先以合伙财产清偿债务，不足部分由合伙人承担无限连带责任（即使退股，对退股前债务仍需负责）。
    
  • 若合伙财产有剩余：退股方可取回剩余财产中其应得部分，但需扣除其应分担的亏损。
    示例：合伙财产剩余80万，亏损100万，甲承担60万、乙承担40万。乙退股时，需先补足40万亏损，剩余40万中乙按出资比例（40%）可取回16万（80万×40% - 40万亏损= -24万，实际无法取回出资，甚至需额外承担）。

3. 继续经营方的权利与义务

• 继续经营权：退股方退出后，继续经营方有权独立决策，但需对合伙债务承担无限连带责任（除非债权人同意债务转移）。
• 是否需补偿退股方：法律无强制要求，但若继续经营方同意补偿（如签订协议），则需履行；若拒绝补偿，退股方无权强制要求（除非存在欺诈、胁迫等情形）。

4. 实务建议

• 清算合伙财产：双方应共同委托第三方机构清算资产、负债，明确剩余财产及亏损金额。
• 签订退股协议：明确退股时间、财产分配、债务承担等条款，避免后续纠纷。
• 办理工商变更：若为有限责任公司或合伙企业，需及时办理股东/合伙人变更登记。

总结：分配方式需结合协议约定与法律规定，核心是“先清偿债务，再分配剩余财产，最后分担亏损”。若涉及复杂情况（如资产评估、债务纠纷），建议进一步提供具体信息，以便针对性分析。