针对无证运输卷烟且当事人逃跑的情况，可分以下步骤处理，核心结论如下：
- 立即启动行政调查程序
根据《烟草专卖法实施条例》第五十二条，无证运输卷烟属于违法行为，烟草专卖行政主管部门（如烟草局）有权立案调查。即使当事人逃跑，执法机关仍可通过以下方式推进：
- 证据固定：对现场查获的卷烟进行扣押、登记，并拍摄照片、录像固定运输工具、路线等证据；
- 关联人调查：通过询问在场人员、调取监控、查询物流信息等方式，锁定当事人身份及同伙信息；
- 公告送达：若无法直接联系当事人，可通过公告方式送达《行政处罚事先告知书》，明确其违法事实及拟处罚内容。
- 依法作出行政处罚决定
若当事人逾期未接受调查或逃避处罚，烟草专卖部门可依据《行政处罚法》第四十条，在证据充分的前提下直接作出处罚决定：
- 处罚内容：没收违法运输的卷烟，并处以违法运输卷烟价值20%-50%的罚款；
- 送达方式：通过邮寄、公告或留置送达（如张贴于当事人住所）完成法律文书送达；
- 强制执行：若当事人拒不履行处罚决定，烟草部门可申请法院强制执行，包括冻结银行账户、查封财产等。
- 涉嫌犯罪的刑事追责
若运输卷烟数量较大（如超过50条）或存在其他严重情节（如伪造许可证、暴力抗法），可能构成《刑法》第二百二十五条规定的非法经营罪。此时需：
- 刑事立案：烟草部门将案件移送公安机关，由其立案侦查；
- 网上追逃：公安机关对逃跑的当事人发布通缉令，通过全国警务系统追捕；
- 量刑标准：根据运输卷烟的价值，可能面临五年以下有期徒刑或拘役，并处违法所得一倍以上五倍以下罚金；情节特别严重的，处五年以上有期徒刑。
- 实务建议
- 对执法机关：需严格遵循“先调查后处罚”程序，确保证据链完整，避免因程序瑕疵导致行政行为被撤销；
- 对当事人：逃跑无法逃避法律责任，反而可能因“拒不配合调查”加重处罚。建议尽快主动联系烟草部门或公安机关，说明情况并配合处理，以争取从轻处罚。
总结：无证运输卷烟且逃跑的，行政机关可依法固定证据、作出处罚并申请强制执行；若涉嫌犯罪，公安机关将启动刑事追责程序。当事人应认识到逃避的严重性，尽早配合调查以减少损失。如有进一步疑问，可直接向我咨询具体法律问题。