关于已经登记发证的土地权属争议，能否按权属争议处理，需根据具体情况综合判断。以下是对此问题的详细分析：
权属争议的一般处理原则
- 土地权属争议，通常指的是土地登记前因土地所有权和使用权归属而发生的争议。但《中华人民共和国土地管理法》第十四条并未明确排除土地发证后的争议处理，规定土地所有权和使用权争议应由当事人协商解决，协商不成的由人民政府处理。这意味着，即使土地已经发证，如果存在权属争议，仍有可能通过政府处理程序来解决。
可按权属争议处理的情况
- 发证程序违法或错误登记：如果争议的核心是土地所有权或使用权的归属不明确，且存在发证程序违法、错误登记等导致实质性争议的情况，那么可以启动土地权属争议处理程序。例如，发证过程中存在隐瞒真实情况、登记机关审核失误等，导致土地错误登记，此时可依法确定土地的真正权属。
- 证书错误或遗漏：在某些特殊情况下，如土地证书存在错误或遗漏等，即使土地已经发证，相关争议仍可能需要按照权属争议的方式进行处理。
不按权属争议处理的情况
- 对发证行为本身不服：如果争议是对发证行为本身不服，如认为发证程序不合法、发证依据不足等，这属于行政复议或行政诉讼的范畴，应通过相应法律途径解决，而不是直接作为权属争议处理。
- 非权属核心问题的争议：基于土地相邻关系等非权属核心问题的争议，如通行、排水、采光等纠纷，或对土地上附着的权益产生的争议，应根据具体情况通过民事诉讼等途径解决。
- 其他类型问题：如果争议涉及土地侵权、行政区域边界争议、土地违法案件等其他类型问题，则需根据相关法律法规进行特殊处理。
实际操作中的处理方式
- 协商解决：当事人应首先尝试通过协商解决争议，这是最直接且成本最低的方式。
- 政府处理：协商不成时，可以向乡级人民政府或县级以上人民政府提出申请，由政府根据相关法律法规和实际情况对争议进行处理。政府处理时，会综合考虑土地的历史使用情况、发证程序、相关证据等因素。
- 法律诉讼：对政府处理决定不服的，可以向人民法院提起诉讼。在诉讼过程中，法院会依法审查相关证据和事实，作出公正判决。
建议与总结：
- 在处理已经登记发证的土地权属争议时，当事人应首先明确争议的核心和性质，判断是否属于权属争议范畴。
- 如果争议确实涉及土地所有权或使用权的归属问题，且存在发证程序违法或错误登记等情况，可以依法启动土地权属争议处理程序。
- 如果争议是对发证行为本身不服或涉及其他类型问题，则应根据具体情况选择相应的法律途径解决。
- 在整个处理过程中，当事人应积极收集相关证据和材料，以便在协商、政府处理或法律诉讼中维护自己的合法权益。
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