合同到期不续签补偿金和协商解除补偿金的应税方式在本质上是一致的，但具体税务处理需根据补偿金的数额来确定。以下是对这一问题的详细分析：
一、应税方式的基本原则
无论是合同到期不续签还是协商解除劳动合同，所支付的补偿金在税务处理上均遵循相同的基本原则，即：
免征个人所得税的情况：
- 如果补偿金在当地上年职工平均工资3倍数额以内的部分，是免征个人所得税的。这一规定体现了对劳动者合理经济补偿的税收优惠政策。
需要缴纳个人所得税的情况：
- 当补偿金数额超过当地上年职工平均工资的3倍时，超出部分需要按照税法规定计算并缴纳个人所得税。
二、具体税务处理
合同到期不续签补偿金的税务处理：
- 补偿金数额在当地上年职工平均工资3倍以内的：免征个人所得税。
- 补偿金数额超过当地上年职工平均工资3倍的：超出部分需依法缴纳个人所得税。具体计算方法为：将超出3倍数额部分的补偿金除以个人在本企业的工作年限数（超过12年的按12年计算），以其商数作为个人的月工资、薪金收入，然后依据综合所得税率表计算应缴纳的税额。
协商解除补偿金的税务处理：
- 协商解除劳动合同的补偿金税务处理与合同到期不续签的补偿金税务处理相同。即，同样根据补偿金数额与当地上年职工平均工资的比较来确定是否需要缴纳个人所得税。
三、注意事项与实际操作
- 补偿金计算方式：无论是合同到期不续签还是协商解除劳动合同，经济补偿金通常根据劳动者在本单位工作的年限来计算，具体为每满一年支付一个月工资的标准。对于六个月以上不满一年的情况，按一年计算；不满六个月的，则向劳动者支付半个月工资的经济补偿。这里的“月工资”指的是劳动合同解除或终止前十二个月的平均工资。
- 地区差异考虑：由于各地区的职工平均工资水平存在差异，因此判断补偿金是否需要扣税以及具体的扣税标准时，必须结合当地的具体规定来执行。
- 税务申报与缴纳：在收到补偿金后，如确定有应税部分，劳动者应依法进行税务申报并及时缴纳相应的税款，以避免可能的税务风险。
四、举例说明
假设某地区上年职工平均工资为10万元，劳动者A在合同到期不续签的情况下获得15万元的补偿金，劳动者B在协商解除劳动合同的情况下获得20万元的补偿金。
对于劳动者A：
- 免征个人所得税的部分：10万元（当地上年职工平均工资的3倍）
- 需要缴纳个人所得税的部分：15万元 - 10万元 = 5万元
- 假设劳动者A在本企业工作年限为5年，则超出部分平均每月为：5万元 ÷ 5年 = 1万元/年（或按实际月份计算，但此处为简化说明），然后依据综合所得税率表计算应缴纳的税额。
对于劳动者B：
- 免征个人所得税的部分：同样为10万元
- 需要缴纳个人所得税的部分：20万元 - 10万元 = 10万元
- 假设劳动者B在本企业工作年限为8年（超过12年的按12年计算，但此处为简化说明），则超出部分平均每月的计算及税额缴纳方式与劳动者A类似，但具体数额会因工作年限和超出金额的不同而有所差异。
总结：合同到期不续签补偿金和协商解除补偿金的应税方式在本质上是一致的，均根据补偿金数额与当地上年职工平均工资的比较来确定是否需要缴纳个人所得税。如有任何疑问或需要进一步的税务指导，请直接向我咨询。