结论：营运车在交通事故中负全责时，超过2000元的损失是否需要自己承担，这主要取决于车辆是否购买了相应的保险以及保险的保额情况。一般情况下，如果购买了足额的保险，超出部分由保险公司承担；若未购买或保额不足，则可能由营运车车主或驾驶员自行承担。
详细分析：
保险覆盖情况：
- 交强险：根据《机动车交通事故责任强制保险条例》，所有营运车辆都必须购买交强险。交强险在有责情况下，财产损失赔偿限额通常为2000元。这意味着，如果事故造成的财产损失不超过2000元，交强险将全额赔偿。但超出2000元的部分，交强险不再承担。
- 商业险：除了交强险，营运车辆通常还会购买商业第三者责任险等商业保险。这些商业保险的保额通常较高，可以覆盖交强险赔偿限额之外的部分。如果购买了足额的商业保险，并且事故造成的损失在保险保额范围内，那么超出2000元的部分将由保险公司承担。
未购买或保额不足的情况：
- 如果营运车辆没有购买商业保险，或者购买的商业保险保额不足以覆盖超出2000元的损失，那么这部分损失将由营运车车主或驾驶员自行承担。
- 在某些特殊情况下，如驾驶员存在故意或重大过失，保险公司可能会拒绝赔偿或部分赔偿，此时超出部分也可能由驾驶员自行承担。
实际操作建议：
- 及时报案：发生交通事故后，应立即向保险公司报案，并按照保险公司的要求提供相关证据和资料。
- 保留证据：妥善保管事故现场的照片、视频、交警出具的事故责任认定书等证据，以便在后续理赔过程中使用。
- 咨询专业律师：如果事故造成的损失较大，或者对理赔过程有疑问，建议咨询专业律师，以维护自己的合法权益。
举例说明：
假设一辆营运车在交通事故中负全责，事故造成的财产损失为5000元。如果该车只购买了交强险，没有购买商业保险，那么保险公司将只赔偿2000元，剩余的3000元将由营运车车主或驾驶员自行承担。如果该车除了交强险外，还购买了保额为10万元的商业第三者责任险，那么这5000元的损失将全部由保险公司承担。
后续行动建议：
- 如果您是营运车车主或驾驶员，建议定期检查车辆的保险情况，确保购买了足额的保险，以应对可能发生的交通事故。
- 如果您在交通事故中遭受了损失，并且对方是营运车且负全责，您可以先与对方协商理赔事宜。如果协商无果，您可以考虑通过法律途径维护自己的权益。
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