关于员工冬天上班迟到扣钱以及下班加班是否合法的问题，需要分情况讨论：

一、关于迟到扣钱

1. 合法性原则：

   • 根据《中华人民共和国劳动合同法》及相关规定，用人单位在制定规章制度时，应确保内容合法、合理，且经过民主程序制定并公示或告知劳动者。若规章制度中明确规定了迟到扣钱的条款，并且该条款不违反法律法规的强制性规定，那么用人单位依据此条款对迟到员工进行扣钱，在法律上可能是被认可的。

2. 合理性考量：

   • 即便规章制度中有迟到扣钱的条款，用人单位也应确保扣钱的金额合理，不能过度惩罚。例如，扣钱金额不应超过员工当月工资的20%，且扣除后的剩余工资不得低于当地最低工资标准。若扣钱金额过高或不合理，可能被视为违法。

3. 特殊情况：

   • 在冬天等恶劣天气条件下，若员工因不可抗力（如道路封闭、交通瘫痪等）导致迟到，用人单位应考虑实际情况，不宜直接扣钱。此时，双方应协商解决，体现用人单位的人文关怀。

二、关于下班加班

1. 加班的合法性：

   • 根据《中华人民共和国劳动法》的规定，用人单位因生产经营需要，经与工会和劳动者协商后，可以安排劳动者加班。但加班时间一般每日不得超过一小时，因特殊原因需要延长工作时间的，在保障劳动者身体健康的条件下延长工作时间每日不得超过三小时，但是每月不得超过三十六小时。

2. 加班工资的支付：

   • 若用人单位安排员工加班，应依法支付加班工资。具体标准为：工作日加班支付不低于工资的百分之一百五十的工资报酬；休息日加班又不能安排补休的，支付不低于工资的百分之二百的工资报酬；法定休假日加班的，支付不低于工资的百分之三百的工资报酬。

3. 员工权益保护：

   • 员工有权拒绝用人单位的违法加班要求。若用人单位强迫员工加班或未支付加班工资，员工可以向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，维护自己的合法权益。

总结与建议：

• 对于迟到扣钱，用人单位应确保规章制度合法、合理，并考虑特殊情况下的员工权益。
• 对于下班加班，用人单位应依法与员工协商，并支付相应的加班工资。员工也有权拒绝违法加班要求，并维护自己的合法权益。

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