结论前置：员工请假扣双倍工资通常是不符合法律规定的，劳动者有权依法维护自己的合法权益。以下从不同角度进行详细分析：
一、法律层面分析
《中华人民共和国劳动法》第五十条：
- 工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。这一条款明确规定了用人单位不得随意扣减劳动者的工资，请假扣双倍工资显然违反了这一规定。
《工资支付暂行规定》第十六条：
- 因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%，且扣除后的剩余工资不得低于当地月最低工资标准。请假本身并不构成给单位造成经济损失的情况，因此用人单位无权以此为由扣双倍工资。
《中华人民共和国劳动合同法》第三十条：
- 用人单位应当按照劳动合同约定和国家规定，向劳动者及时足额支付劳动报酬。用人单位拖欠或者未足额支付劳动报酬的，劳动者可以依法向当地人民法院申请支付令。这一条款进一步强调了用人单位按时足额支付劳动报酬的义务。
二、不同请假类型分析
事假：
- 员工请事假期间，用人单位可以不支付其事假工资，但不能额外多扣工资。若劳动合同或单位规章制度中有关于事假扣双倍工资的规定，该规定需符合法律要求，即不能违反《劳动法》及《工资支付暂行规定》中关于工资扣除的限制。
病假：
- 劳动者患病或非因工负伤治疗期间，单位应按规定支付其病假工资或疾病救济费，这通常低于正常工资，但不能低于最低工资标准的80%。单位无权扣双倍病假工资，而应依据相关规定支付。
婚假、产假、丧假等法定假期：
- 这些假期是劳动者依法享受的权益，用人单位应视为正常出勤并支付全额工资。任何以请假为由扣双倍工资的行为都是违法的。
三、应对措施与建议
与用人单位协商：
- 首先，建议劳动者尝试与用人单位进行友好协商，向其说明这种扣薪方式不符合法律规定，要求其纠正错误，并补发多扣的工资。通过沟通，很多时候可以解决问题，避免矛盾进一步激化。
申请劳动仲裁或投诉：
- 如果协商无果，劳动者可以向当地劳动争议仲裁委员会申请仲裁，或者向劳动行政部门投诉。在申请仲裁时，需要准备相关证据，如劳动合同、工资条、请假记录等，以证明工资被不合理扣除的事实。
提起诉讼：
- 如果对仲裁结果不满意，劳动者还可以向人民法院提起诉讼。在诉讼过程中，法院将对案件进行全面审查，并根据法律规定作出判决。需要注意的是，诉讼程序相对复杂，耗时较长，因此劳动者需要做好充分的准备。
寻求法律援助：
- 在必要时，劳动者还可以寻求法律援助，以获得专业的法律支持和帮助，通过法律途径解决争议。
四、企业管理建议
完善考勤制度：
- 明确不同类型假期（病假/事假/年假）的工资计算标准，确保规则透明化。建立弹性调休机制，允许员工通过加班时长兑换额外休假。
优化管理流程：
- 开发数字化请假系统，实现审批流程可视化追踪。对频繁请假员工进行面谈辅导，了解其实际需求并提供支持方案。
强化法律意识：
- 定期组织HR部门学习最新劳动法规，及时更新内部管理制度。在劳动合同中明确工资构成及扣款条件，避免模糊表述引发的纠纷。
综上所述，员工请假扣双倍工资是不合法的。劳动者在遇到此类情况时，应了解自己的权利，并依法采取相应措施来维护自己的合法权益。如果你有任何法律问题或需要进一步的帮助，请直接向我咨询。