注册多个店铺开烟店是否违法，需分情况讨论：

1. 若符合烟草专卖法律法规及工商登记规定：

   • 在符合当地烟草专卖零售点合理布局规划，且已取得烟草专卖零售许可证的前提下，注册多个店铺并分别申请烟草专卖零售许可证，是合法的。每个店铺需独立申请许可证，并确保符合相关条件，如经营场所、资金、人员等。
   • 法律依据：根据《中华人民共和国烟草专卖法》及其实施条例，从事烟草专卖零售业务，必须依照《烟草专卖许可证管理办法》的规定，申请领取烟草专卖零售许可证。同时，各地烟草专卖局会根据实际情况制定零售点合理布局规划，以控制市场饱和度，保障合法经营者的利益。

2. 若存在以下情形，则可能违法：

   • 无证经营：未取得烟草专卖零售许可证而擅自销售烟草制品，属于违法行为。根据《烟草专卖法》第三十二条，无烟草专卖零售许可证经营烟草制品零售业务的，由工商行政管理部门责令停止经营烟草制品零售业务，没收违法所得，并处罚款。
   • 一证多店：使用一个烟草专卖零售许可证在多个店铺销售烟草制品，也是违法的。每个店铺需独立申请许可证，不得共用或转让许可证。
   • 超出经营范围：即使持有烟草专卖零售许可证，若超出许可证规定的经营范围（如销售非烟草制品、销售假冒伪劣烟草制品等），同样构成违法。
   • 违反零售点布局规划：在不符合当地烟草专卖零售点合理布局规划的情况下申请许可证，或通过不正当手段获取许可证，也可能面临法律制裁。

法律建议：

• 在注册多个店铺开烟店前，务必了解并遵守当地烟草专卖法律法规及工商登记规定。
• 确保每个店铺都独立申请并取得烟草专卖零售许可证，避免一证多店或无证经营。
• 定期检查店铺经营情况，确保不超出许可证规定的经营范围，不销售假冒伪劣烟草制品。
• 如遇法律纠纷或行政处罚，及时咨询专业律师，了解自身权益和义务，积极应对。

可能后果：

• 若违法经营烟草制品，可能面临工商行政管理部门的处罚，包括责令停止经营、没收违法所得、罚款等。
• 情节严重的，还可能构成犯罪，依法追究刑事责任。例如，销售假冒注册商标的烟草制品，可能构成销售假冒注册商标的商品罪。

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