如果发现自己的身份信息被盗用去注册公司，并且该公司还涉及虚开发票的情况，这确实是一个严重的问题，但您不必过于恐慌，通过一系列综合法律手段，您可以有效维护自己的权益，并且通常不会因此直接负刑事责任（除非您本身参与或知情）。以下是详细的解答和建议：
一、立即收集证据并报案
收集证据：
- 身份盗用证据：寻找非本人签署的公司注册文件，如公司章程、股东协议等，以及能证明自己对公司注册不知情的材料，如行踪证明、工作证明等。
- 虚开发票证据：向税务机关申请查询该公司的税务申报情况和发票开具记录，这些记录将作为虚开发票的关键证据。
报案：
- 携带上述证据，立即向公安机关经济犯罪侦查部门报案，详细陈述身份信息被盗用及该公司虚开发票的情况。
- 同时，向工商行政管理部门（市场监督管理局）和税务机关举报，请求他们协助调查处理，并对虚开发票行为进行查处。
二、申请撤销工商登记
提交申请：
- 在确认身份被盗用后，向公司登记机关提交书面申请，请求撤销该公司的虚假登记。
- 申请材料应包括身份证明、身份信息被盗用的证据、撤销登记的请求书等。
等待处理：
- 登记机关受理后会进行调查核实，并依法作出是否撤销登记的决定。
- 若撤销成功，将恢复您的名誉和信用，减少因此带来的负面影响。
三、法律途径维权
提起行政诉讼：
- 如果撤销登记未能实现，且您能提供充分证据证明身份被盗用且公司登记行为与您无关，可向法院提起行政诉讼，要求撤销公司工商登记的具体行政行为。
民事赔偿诉讼：
- 因身份信息被盗用导致的经济损失，如信用受损、商业机会丧失等，可通过民事诉讼要求侵权人赔偿损失。
- 需提供充分的证据证明损失的存在及其与侵权行为之间的因果关系。
聘请专业律师：
- 在整个过程中，聘请专业律师是非常重要的。律师可以提供法律咨询、协助收集证据、撰写法律文书，并在必要时代表您出庭诉讼，确保您的合法权益得到有效维护。
四、关于刑事责任
- 一般情况下不负刑事责任：如果您本身并未参与或知情公司注册及虚开发票的行为，那么您通常不会因此直接负刑事责任。刑事责任将由实际实施这些行为的人承担。
- 特殊情况：如果您在发现身份被盗用后，未及时采取措施阻止或报告，导致损失扩大或情节严重，可能会在一定程度上承担法律责任，但这种情况较为罕见。
五、信用修复与个人信息保护
信用修复：
- 在维权的同时，关注自己的信用记录。若发现信用记录存在异常，可向信用管理机构提出信用修复申请，并提交相关证明材料以恢复信用状况。
个人信息保护：
- 为了避免类似事件再次发生，必须加强个人信息保护。妥善保管身份证等重要证件，不随意透露个人信息，特别是在网络环境中要格外警惕。
综上所述，面对身份被盗用注册公司并虚开发票的情况，您应立即采取行动，通过收集证据、报案、申请撤销登记、提起法律诉讼以及加强个人信息保护等综合措施来维护自己的合法权益。同时，不必过于担心刑事责任问题，只要您本身并未参与或知情这些行为，通常不会因此直接负刑事责任。