在建工程存在抵押的情况下，原则上是可以转让的，但必须严格遵循相关法律法规和程序，确保抵押权人的权益不受损害，并保障交易的合法性和有效性。以下是对此问题的详细分析：
一、法律依据与规定
《中华人民共和国民法典》第四百零六条：
- 抵押期间，抵押人可以转让抵押财产。当事人另有约定的，按照其约定。抵押财产转让的，抵押权不受影响。
- 抵押人转让抵押财产的，应当及时通知抵押权人。抵押权人能够证明抵押财产转让可能损害抵押权的，可以请求抵押人将转让所得的价款向抵押权人提前清偿债务或者提存。转让的价款超过债权数额的部分归抵押人所有，不足部分由债务人清偿。
《城市房地产管理法》及《城市房地产抵押管理办法》：
- 已抵押的在建工程需转让时，必须经抵押权人书面同意。
- 转让所得款项须优先偿还抵押债务，剩余部分方可归抵押人所有。
二、转让条件与流程
抵押权人同意：
- 在建工程抵押的转让，必须事先获得抵押权人的书面同意。这是保护抵押权人权益的重要措施，防止抵押物价值因未经同意的转让而受损。
通知抵押权人并处理资金：
- 抵押人需及时通知抵押权人关于在建工程的转让事宜。
- 若抵押权人认为转让可能损害其权益，如价格明显不合理，可要求抵押人将转让所得价款提前清偿债务或提存。
签订买卖合同并备案：
- 与买受人签订正式买卖合同，并按规定完成合同备案手续，确保交易的合法性。
资金监管与债务清偿：
- 将转让所得款项存入指定监管账户，优先用于偿还抵押债务，保障抵押权人权益。
办理解除抵押与过户手续：
- 债务清偿后，协助抵押权人办理解除抵押登记，再为买受人办理产权过户。
三、可能存在的风险与应对措施
抵押权实现风险：
- 在建工程转让后，其形态、价值等可能发生变化，增加抵押权人实现抵押权的难度。因此，抵押权人应密切关注在建工程的状态，并在必要时采取相应措施保护自身权益，如要求抵押人提供额外的担保或增加监管措施。
受让人风险：
- 受让人购买已设定抵押权的在建工程存在风险。若抵押人未按时清偿债务，抵押权人有权行使抵押权，可能导致受让人面临工程被处置的风险。因此，受让人在购买前应充分了解抵押情况，并谨慎决策，可以要求抵押人提供抵押权人同意转让的书面证明，并确保转让所得价款用于清偿债务。
法律手续复杂性：
- 出售在建工程涉及复杂的法律手续和程序，如签订买卖合同、办理备案、资金监管、债务清偿、解除抵押和过户等。建议各方在操作过程中咨询专业律师，以确保所有手续的合法性和有效性，避免因手续不全或违法而导致的交易无效或赔偿损失。
四、实际操作建议
提前规划与咨询：
- 在建工程抵押的转让涉及多方利益和复杂法律程序，建议提前规划并咨询专业律师，制定详细的转让方案和风险防控措施。
确保资金安全：
- 在转让过程中，应确保转让所得款项的安全和合规使用，避免资金被挪用或滥用，导致抵押权人权益受损。
完善合同条款：
- 在签订买卖合同时，应明确约定转让条件、资金处理、违约责任等条款，确保各方权益得到充分保障。
综上所述，虽然在建工程存在抵押的情况下可以转让，但必须严格遵守相关法律法规和程序要求，特别是要征得抵押权人的同意并妥善处理资金问题。对于各方而言，更应提高警惕，确保自身权益不受侵害。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。