在出租车司机肇事且保险赔偿不足的情况下，赔偿责任主体需根据车辆运营模式及各方过错综合判定，不一定是车主。具体分析如下：

1. 车辆挂靠经营模式
   若出租车挂靠于运输公司，司机与车主（实际出资人）为挂靠关系，根据《民法典》第1211条，司机与挂靠公司需承担连带赔偿责任。车主作为挂靠方，若对事故存在过错（如车辆未年检、明知司机无资质仍允许驾驶等），需与司机共同担责；若无过错，则由司机个人承担超出保险限额的赔偿。

2. 承包/租赁经营模式
   若车主将车辆承包或租赁给司机运营，根据《民法典》第1209条，发生事故时由机动车使用人（司机）承担赔偿责任。但若车主对损害发生有过错（如未投保交强险、车辆存在安全隐患等），需承担相应赔偿责任。例如，车主明知车辆制动系统故障仍出租，需对事故损失扩大部分担责。

3. 雇佣关系模式
   若司机受雇于车主或运输公司，根据《民法典》第1192条，雇主需承担赔偿责任。但若司机存在故意或重大过失（如酒驾、超速等），雇主可向司机追偿。例如，司机因疲劳驾驶导致事故，车主赔偿后有权要求司机分担部分损失。

4. 特殊情形：车主与司机身份重合
   若车主本人驾驶车辆肇事，且保险不足，车主需自行承担超出保险限额的赔偿责任。此时无其他责任主体，车主需以个人财产履行赔偿义务。

建议行动：

1. 立即收集事故认定书、保险合同、车辆运营协议等证据，明确各方关系及过错；
   
2. 优先通过保险理赔，不足部分根据上述模式确定责任主体；
   
3. 若协商无果，可向法院起诉要求责任方赔偿，并申请财产保全以确保执行。
   

如有进一步细节需分析（如具体运营模式、事故责任划分等），可直接向我咨询。