水利水电工程的质保期，即缺陷责任期或保修期，一般不少于1年，但具体时间可根据工程实际情况和合同双方约定来确定，且双方约定在不违反法律法规强制性规定的情况下是合法的。以下是对这一问题的详细分析：

一、质保期的基本规定

1. 起始时间：水利工程的质保期通常从工程通过合同工程完工验收后开始计算，或者从工程移交证书写明的工程完工日起算。这是依据《水利工程质量保修管理办法》及行业惯例所确定的基本原则。

2. 一般时长：根据相关规定，水利工程的质保期一般不少于1年。这是水利工程项目中最基本的质保要求，确保了工程在交付后的一段时间内能够得到有效维护和修理。

二、质保期的特殊规定与调整因素

1. 特殊要求的部位和材料：

   • 对于有防水要求的部位，质保期一般不少于5年。
   • 电气管线、给排水管道、设备安装和装修工程，质保期通常为2年。
   • 堤防工程、河道疏浚工程等大中型水利工程，保修期可能为1至2年。
   • 各类泵站工程、拦河水闸工程等涉及机电设备的水利工程，保修期可能为2至3年，其中机电设备部分的保修时间通常会按照相关厂家的标准执行，且不少于1年。

2. 合同约定与调整：

   • 具体质保期时长会在工程承包合同中详细约定。合同双方可以根据工程特点、材料特性、使用需求等因素，在法律法规允许的范围内对质保期进行灵活调整。但调整后的质保期通常不得低于上述最低标准，以确保工程的基本质量保障。

三、双方约定的合法性

1. 合同自由原则：在民事法律关系中，合同双方享有合同自由原则，即可以在不违反法律法规强制性规定的前提下，自由约定合同的内容，包括质保期。因此，水利水电工程质保期的双方约定，在不违反相关法律法规的情况下，是具有合法性的。

2. 法律法规的约束：虽然合同双方可以自由约定质保期，但这一约定必须遵守相关法律法规的规定。例如，质保期不得低于法律法规规定的最低标准，否则该约定可能被视为无效。此外，如果合同中的质保期约定违反了公序良俗或损害了社会公共利益，也可能被认定为无效。

四、实际操作中的建议

1. 明确约定：在签订水利工程建设合同时，应明确约定质保期的具体时间和相关责任。这有助于确保工程项目的质量，并为后续维护提供法律保障。

2. 遵守法律法规：在约定质保期时，应严格遵守相关法律法规的规定，确保约定的合法性和有效性。

3. 加强沟通与合作：发承包双方应加强沟通与合作，共同推动水利工程的健康发展。在质保期内，承包人应积极履行修复义务，确保工程的正常运行和安全性；发包人则应提供必要的协助和支持，共同维护工程的质量和效益。

总结：水利水电工程的质保期一般不少于1年，但具体时间可根据工程实际情况和合同双方约定来确定。双方约定在不违反法律法规强制性规定的情况下是合法的。在实际操作中，应明确约定质保期的具体时间和相关责任，并严格遵守相关法律法规的规定。如有任何疑问或争议，可以直接向我咨询。