货车擅自加长货箱属于违法行为，这一行为违反了《中华人民共和国道路交通安全法》以及《机动车登记规定》中关于不得擅自改变机动车已登记的结构、构造或特征的相关规定。针对这一违法行为，交警部门会依据具体情况采取相应的处罚措施。

首先，交警会责令车主将货车恢复原状，即拆除擅自加装的加长部分，确保车辆的结构和尺寸符合初始登记的标准。这是为了维护道路交通安全，防止因非法改装而引发的交通事故。

其次，对于初次违法且情节较轻、对道路交通安全影响较小的情况，交警可能会给予警告处罚。这是一种行政告诫，旨在提醒当事人其行为的违法性，并要求其立即改正。

然而，如果违法情节较为严重，或者加长幅度较大，严重影响了车辆的安全性能和正常行驶秩序，那么车主将面临罚款处罚。根据《机动车登记规定》，擅自改变机动车外形和已登记的有关技术数据的，一般会被处以二百元以下罚款。但具体数额可能因地区差异和违法情节严重程度而有所不同，某些地区可能会接近或达到法规规定的上限。

如果您确实存在加长货车货箱的需求，我建议您按照法定程序向当地的交通管理部门提出申请，并提交相关材料证明改装的必要性和安全性。在获得许可后，您才能按照批准的方案进行改装，并确保改装后的车辆符合所有安全技术标准。

总之，遵守法律法规是每位公民的责任，也是保障道路交通安全的重要途径。我建议您在面对类似情况时，首先了解并遵守相关的法律法规，避免擅自进行非法改装。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请咨询当地的交通管理部门或专业律师。