在破产拍卖中，若在建工程存在抵押，职工债权的处理需遵循法定清偿顺序，抵押权人优先受偿权不影响职工债权在法定范围内的优先性，但超出破产财产清偿能力的部分可能无法全额受偿。具体分析如下：

1. 职工债权的法定优先性
   根据《企业破产法》第113条，职工债权（包括工资、医疗伤残补助、抚恤费用、社保费用及补偿金）在破产财产清偿中享有第二顺位优先权，仅次于破产费用和共益债务。即使在建工程存在抵押，职工债权仍优先于普通债权受偿，但劣后于抵押权人的担保债权。

2. 抵押权与职工债权的清偿顺序冲突

   • 抵押权优先范围：抵押权人对在建工程的变价款享有优先受偿权，其债权范围以抵押物价值为限（《民法典》第394条）。
     
   • 职工债权受偿条件：若抵押物变价款足以覆盖抵押债权，剩余部分需优先清偿职工债权；若抵押物变价款不足以覆盖抵押债权，职工债权仅能就剩余破产财产（如有）按比例受偿，可能面临无法全额清偿的风险。

3. 破产财产不足时的处理

   • 管理人职责：管理人需依法编制债权表，明确职工债权范围及金额，并在债权人会议上核查（《企业破产法》第48条）。
     
   • 政府垫付与追偿：若职工债权因财产不足无法清偿，部分地区可能通过政府应急周转金先行垫付，后续由管理人向抵押权人追偿后返还政府（需以地方性法规为依据）。
     
   • 例外情形：根据《企业破产法》第132条，若破产企业在《企业破产法》公布前（2006年8月27日前）欠付的职工债权，可优先于抵押权人受偿，但此情形已极少适用。

4. 实务建议

   • 职工维权路径：职工应及时向管理人申报债权，并要求管理人提供抵押物评估报告及变价方案，监督清偿流程。
     
   • 抵押权人风险控制：抵押权人需在抵押合同中明确约定在建工程抵押范围（如土地使用权、在建建筑物等），并办理抵押登记，以对抗后续查封或优先权主张。
     
   • 管理人操作要点：管理人应委托专业机构对在建工程进行价值评估，制定变价方案时需兼顾抵押权人与职工债权利益，避免因程序瑕疵引发诉讼。

提示：若涉及具体案件，需进一步审查抵押合同效力、职工债权形成时间及金额、破产财产评估报告等材料，以制定精准维权策略。如有疑问，可直接向我咨询。