非法捕捞罪并非直接由渔业部门移交，而是通常由公安机关立案侦查后，根据案件情况决定是否移送检察机关审查起诉。以下是对此问题的详细分析：

一、非法捕捞罪的立案侦查主体

非法捕捞罪，即非法捕捞水产品罪，是指违反保护水产资源法规，在禁渔区、禁渔期或者使用禁用的工具、方法捕捞水产品，情节严重的行为。根据我国刑事诉讼法的规定，刑事案件的立案侦查主要由公安机关负责。因此，非法捕捞罪一般由公安机关进行立案侦查。

二、渔业部门在非法捕捞罪中的角色

渔业部门作为渔业资源的管理和保护机构，在发现非法捕捞行为时，会进行初步的调查和取证工作。然而，渔业部门并不具备直接立案侦查刑事案件的权力。他们通常会将发现的非法捕捞线索移交给公安机关，由公安机关进行进一步的调查和处理。

三、非法捕捞罪的移送流程

1. 发现线索：渔业部门在巡查、执法等过程中发现非法捕捞行为，进行初步调查和取证。
2. 移送线索：渔业部门将收集到的线索和证据移交给公安机关，由公安机关决定是否立案侦查。
3. 立案侦查：公安机关对移送的线索进行审查，认为符合立案条件的，进行立案侦查，收集更多证据，查明犯罪事实。
4. 移送审查起诉：公安机关侦查终结后，认为犯罪事实清楚，证据确实、充分的，将案件移送检察机关审查起诉。

四、特殊情况下的处理

在某些情况下，如果非法捕捞行为情节轻微，不构成犯罪，或者虽然构成犯罪但情节显著轻微，不需要判处刑罚的，公安机关可能会根据《中华人民共和国治安管理处罚法》的相关规定，对违法行为人进行行政处罚，而不会移送检察机关审查起诉。

五、法律建议

对于涉嫌非法捕捞罪的行为人，建议积极配合公安机关的调查工作，如实陈述事实，提供相关证据。同时，也可以寻求专业律师的帮助，了解自己的权利和义务，以及可能面临的法律后果。

如有任何关于非法捕捞罪或其他法律问题的疑问，可以直接向我咨询。