结论前置：双方达成赔偿协议但不签字，一般情况下不能直接结案，但具体能否结案需视情况而定，包括是否通过其他方式确认了协议内容、是否已实际履行赔偿义务以及是否涉及诉讼程序等。
一、非诉讼程序下的情况
口头协议与实际履行：
- 在非诉讼程序中，如果双方已经就赔偿事宜达成了口头协议，并且一方已经按照协议内容实际履行了赔偿义务，另一方也接受了赔偿，那么即使没有书面签字，该协议在事实上也是成立的。但这种情况下，如果日后发生争议，举证可能会相对困难，因为缺乏书面证据。
- 建议：为了降低风险，最好还是将赔偿协议以书面形式固定下来，并由双方签字确认。
通过其他方式确认协议内容：
- 如果双方通过电子邮件、短信、微信等电子方式就赔偿事宜进行了沟通，并达成了共识，这些电子记录也可以作为证明协议存在的证据。但同样，这些电子证据在举证时可能需要经过公证等程序，以增加其证明力。
- 建议：在通过电子方式沟通时，尽量明确、具体地表述协议内容，并保留好相关记录。
二、诉讼程序下的情况
调解协议与司法确认：
- 在诉讼程序中，如果双方在法院的主持下达成了调解协议，但拒绝签字，那么该调解协议通常不会直接产生法律效力。然而，如果双方已经实际履行了调解协议的内容，或者法院根据调解协议的内容制作了调解书并送达给了双方，那么即使一方拒绝签字，调解书也可能具有法律效力。
- 法律依据：根据《中华人民共和国民事诉讼法》的相关规定，调解达成协议，人民法院应当制作调解书。调解书应当写明诉讼请求、案件的事实和调解结果。调解书由审判人员、书记员署名，加盖人民法院印章，送达双方当事人。调解书经双方当事人签收后，即具有法律效力。但需要注意的是，如果调解书送达前一方反悔的，人民法院应当及时判决。
- 建议：在诉讼程序中，如果双方达成了调解协议，最好还是签字确认，以确保调解协议的法律效力。如果一方拒绝签字，但已经实际履行了调解协议的内容，可以及时向法院说明情况，请求法院根据实际情况作出处理。
判决与执行：
- 如果双方无法就赔偿事宜达成协议，或者一方拒绝履行已经达成的协议，那么另一方可以向法院提起诉讼，请求法院作出判决。如果法院判决一方承担赔偿责任，而该方拒绝履行判决义务，那么另一方可以申请法院强制执行。
- 建议：在诉讼程序中，如果一方拒绝履行判决义务，另一方应及时向法院申请强制执行，以维护自己的合法权益。
总结与进一步行动建议：双方达成赔偿协议但不签字，能否结案取决于多种因素。在非诉讼程序中，如果双方已经实际履行了协议内容或者通过其他方式确认了协议内容，那么可能不需要签字也能结案；但在诉讼程序中，为了确保调解协议或判决的法律效力，最好还是签字确认。如果你面临类似情况，建议直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供更详细的法律建议。