“合法夫妻又是不能在一起”这种情况，通常涉及的是夫妻双方因各种原因无法共同生活，但婚姻关系仍然存续的法律状态。以下是从不同角度对这一问题的详细分析：
法律上的婚姻关系：
- 合法夫妻意味着双方已经依法登记结婚，享有法律赋予的夫妻权利和义务。
- 即使双方因工作、学习、健康或其他原因暂时或长期无法共同生活，婚姻关系仍然有效，除非通过法律程序（如离婚）解除。
无法共同生活的原因：
- 工作或学习原因：如一方因工作调动、出国留学等长期离家，导致夫妻无法共同生活。这种情况下，双方可以通过沟通协商，维持婚姻关系，并尝试通过定期探望、视频通话等方式保持联系。
- 健康原因：如一方因疾病需要长期治疗或康复，无法与另一方共同生活。这种情况下，双方应相互理解、支持，并共同面对困难。
- 感情破裂：虽然双方仍是合法夫妻，但感情已经破裂，无法继续共同生活。这种情况下，双方可以考虑通过离婚来解除婚姻关系，但在此之前，仍需履行夫妻间的法律义务，如互相扶养等。不过，若感情破裂到一定程度，且双方均同意离婚，可以协商或诉讼离婚。
法律后果与应对措施：
- 若选择维持婚姻关系：双方应继续履行夫妻间的法律义务，如互相忠实、互相扶养等。同时，可以通过沟通协商，寻找解决无法共同生活问题的方法，如调整工作、学习安排，或寻求医疗帮助等。
- 若选择离婚：双方可以协商离婚，就财产分割、子女抚养等问题达成一致意见，并签订离婚协议。若协商不成，可以向人民法院提起离婚诉讼。在诉讼过程中，法院会根据双方的具体情况，判决是否准予离婚，并就财产分割、子女抚养等问题作出裁决。
特殊情况下的处理：
- 分居：若双方因感情破裂等原因分居，且分居时间较长（通常认为连续分居满两年），可能构成离婚的法定理由之一。但分居本身并不直接导致婚姻关系解除，仍需通过法律程序来确认。
- 涉外婚姻：若涉及涉外婚姻，因各国法律制度不同，处理方式也会有所差异。在这种情况下，建议咨询具有涉外婚姻法律经验的律师，以获取更具体的法律建议。
针对您的情况，我建议：
- 首先明确双方无法共同生活的具体原因，以及双方对婚姻关系的态度。
- 若双方仍希望维持婚姻关系，应积极沟通协商，寻找解决问题的方法。
- 若双方均认为婚姻关系已无法继续维持，应考虑通过离婚来解除婚姻关系，并就相关问题达成一致意见或寻求法律帮助。
如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。