没有底薪的情况下，迟到扣工资是否合法需根据具体情况来判断。以下是从不同角度的详细分析：
一、一般情况：可能违法
根据《中华人民共和国劳动法》和《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，且不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。即使劳动合同或工作协议中没有明确约定底薪，但劳动者提供了正常劳动，用人单位就应当按照约定支付相应的劳动报酬。因此，在没有底薪的情况下，如果劳动者已完成了相应的工作任务，仅因迟到就被扣钱，且这种扣钱行为没有合法有效的规章制度作为依据，那么这种做法可能构成无故克扣工资。因为迟到与劳动者已完成的工作成果之间通常没有直接的因果关系，且扣除工资可能使劳动者的实际收入低于当地最低工资标准，这是违法的。
二、特殊情况：可能合法
有合法有效的规章制度：
- 用人单位若制定了合法有效的规章制度，并且该制度经过了民主程序制定（如职工代表大会讨论通过），同时已向劳动者公示或告知。
- 规章制度中明确规定了迟到的扣钱标准和方式，且这些规定是合理的，例如，扣款金额与迟到时间成正比，且不会使劳动者当月工资低于当地最低工资标准。
- 在这种情况下，用人单位按照规章制度对迟到的劳动者进行扣款，可能被认定为合法。
迟到造成实际损失：
- 如果劳动者迟到的行为确实给用人单位造成了实际损失，如导致重要业务延误、客户流失等。
- 用人单位需要提供充分的证据证明损失的存在以及损失与劳动者迟到之间的直接因果关系。
- 扣除的金额应当合理，且不能超过劳动者因迟到给单位造成的实际损失，同时扣除后的工资不得低于当地最低工资标准。
三、其他注意事项
- 最低工资标准：无论是否有底薪，劳动者的工资都不得低于当地规定的最低工资标准。这是用人单位必须遵守的强制性规定。
- 协商解决与维权途径：如果劳动者认为用人单位的扣款行为不合法或不合理，首先可以尝试与用人单位协商解决；协商不成时，可以向当地的劳动监察部门投诉，或者申请劳动仲裁来维护自己的合法权益。
四、实际建议
- 劳动者：在签订劳动合同时，应仔细阅读合同条款，了解自己的权益和义务。如果遇到没有底薪且因迟到被扣工资的情况，应首先确认用人单位的规章制度是否合法有效，并评估扣款是否合理。如果认为自己的权益受到侵害，应及时采取行动维护自己的合法权益。
- 用人单位：应制定合法有效的规章制度，并确保这些制度经过民主程序制定且已向劳动者公示或告知。在执行规章制度时，应严格按照制度执行，不得随意变更或滥用权力。同时，应确保劳动者的工资不低于当地最低工资标准，以避免不必要的法律纠纷。
综上所述，没有底薪的工作迟到扣钱是否合法，关键在于用人单位是否有合法有效的规章制度作为依据，以及扣款行为是否合理且符合法律法规的规定。如果你有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。