将食品安全保证金私自改变性质为租金是不合法的。以下从不同角度对此问题进行分析：
一、合同性质与变更的合法性
合同性质：
- 食品安全保证金是承包方为确保食品安全、遵守相关法规及合同约定而向发包方缴纳的一笔资金，其性质属于担保性质的资金，用于在承包方违反食品安全规定或合同约定时，发包方有权扣除相应金额以弥补损失或进行处罚。
- 租金则是承包方为使用发包方提供的场地、设施等而支付的费用，属于对价性质的资金。
变更的合法性：
- 合同双方应当遵循诚实信用原则，按照合同约定履行各自的义务。未经对方同意，任何一方不得擅自变更合同内容。
- 将食品安全保证金私自改变性质为租金，实际上是对合同内容的擅自变更，违反了合同法的相关规定，也损害了对方的合法权益。
二、法律后果
合同无效或可撤销：
- 如果承包方未经发包方同意，擅自将食品安全保证金改变性质为租金，发包方有权要求承包方恢复原状，即恢复食品安全保证金的性质，并可能要求承包方承担违约责任。
- 在极端情况下，如果这种擅自变更行为严重损害了发包方的利益，发包方甚至有权主张合同无效或可撤销。
行政处罚与民事赔偿：
- 如果承包方的行为违反了食品安全相关法规，还可能面临行政处罚，如罚款、吊销许可证等。
- 同时，如果因承包方的行为导致发包方遭受损失，承包方还需承担民事赔偿责任。
三、建议与措施
协商解决：
- 如果双方对食品安全保证金的性质或金额存在争议，建议首先通过协商的方式解决。双方可以重新审视合同条款，明确各自的权利和义务，并达成一致意见。
法律途径：
- 如果协商无果，发包方可以通过法律途径维护自己的合法权益。可以向法院提起诉讼，要求承包方恢复食品安全保证金的性质，并承担违约责任或赔偿责任。
完善合同条款：
- 为了避免类似纠纷的发生，建议在签订合同时，明确约定食品安全保证金的性质、金额、支付方式、使用条件及退还方式等条款。同时，也可以约定在何种情况下可以变更合同内容，以及变更的程序和条件等。
综上所述，将食品安全保证金私自改变性质为租金是不合法的行为，可能引发一系列法律后果。因此，建议双方在签订合同时明确约定相关条款，并在履行合同过程中严格遵守合同约定。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。