公司按当月工作日扣工资是否合法，需分情况讨论：

1. 若公司扣除的是缺勤日工资，且扣除方式符合法律规定，则是合法的。

   • 根据《工资支付暂行规定》第十六条，因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。经济损失的赔偿，可从劳动者本人的工资中扣除，但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%。若扣除后的剩余工资部分低于当地月最低工资标准，则按最低工资标准支付。不过，这一条款主要针对的是因劳动者原因造成的经济损失赔偿，并不直接涉及缺勤日工资的扣除。
   • 在实际操作中，如果劳动者缺勤（如请假、旷工等），公司通常会按照缺勤天数扣除相应日工资。这种扣除方式在劳动合同中有明确约定，且扣除后的工资不低于当地最低工资标准的情况下，是合法的。例如，若员工月工资为5000元，当月缺勤2天，公司扣除这2天的工资（假设日工资为5000元/21.75天≈229.89元，则扣除459.78元），剩余工资4540.22元，只要不低于当地最低工资标准，就是合法的。

2. 若公司无故扣除工作日工资，或扣除方式违反法律规定，则是不合法的。

   • 如果公司没有合理的理由（如劳动者缺勤、违反公司规章制度等）就扣除工作日工资，或者扣除的金额超过了法律规定的限额（如每月扣除超过当月工资的20%），或者扣除后的工资低于当地最低工资标准，那么这种扣除方式就是不合法的。
   • 例如，若员工月工资为5000元，公司无故扣除1000元，且没有合理的解释或依据，那么这种扣除就是不合法的。员工有权要求公司补发被扣除的工资，并可能向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。

建议：

• 劳动者应仔细阅读劳动合同中的工资支付条款，了解公司扣除工资的具体规定和条件。
• 如果公司扣除工资的行为存在疑问或争议，劳动者可以与公司进行沟通协商，要求公司给出合理的解释和依据。
• 如果沟通协商无果，劳动者可以向当地的劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，以维护自己的合法权益。

可能涉及的法律后果：

• 如果公司无故扣除工资或扣除方式违反法律规定，劳动者有权要求公司补发被扣除的工资，并可能获得相应的经济补偿。
• 公司还可能面临劳动监察部门的处罚或劳动仲裁机构的裁决，要求其改正违法行为并支付相应的赔偿。

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