结论：施工单位资质有效但人员配备不齐的情况下，施工行为是否有效不能一概而论，需结合具体情形判断。以下从不同角度进行分析：
一、从合同效力角度分析
合同有效情形：
- 若施工单位资质有效，且合同中未明确约定人员配备的具体要求或该要求并非合同生效的必要条件，那么人员配备不齐通常不会影响合同的整体效力。此时，施工行为在合同层面仍被视为有效，但施工单位可能因违反合同中的某些条款（如关于人员配备的承诺）而需承担违约责任。
合同可能无效或部分无效情形：
- 若合同中明确约定了施工单位必须配备特定人员，且该约定是合同生效或继续履行的关键条件，而施工单位未能满足这一要求，那么根据合同法的相关规定，该部分条款可能因违反合同目的或条件而无效。然而，这并不意味着整个合同无效，除非该条款是合同的核心条款，且其无效导致整个合同的目的无法实现。
二、从行政监管角度分析
行政处罚风险：
- 根据相关法律法规，施工单位在承接工程时必须满足一定的人员配备要求。若人员配备不齐，施工单位可能面临行政处罚，如罚款、停业整顿、吊销资质证书等。这些行政处罚并不直接影响施工行为的民事效力，但会对施工单位的声誉和后续经营产生负面影响。
工程验收风险：
- 人员配备不齐可能影响工程的质量和安全，进而影响工程的验收。若工程因人员配备问题未能通过验收，施工单位可能需要承担返工、修复等费用，并可能面临业主的索赔。
三、从实际施工效果角度分析
施工质量与安全：
- 人员配备不齐可能导致施工质量下降或安全隐患增加。若因此造成工程质量问题或安全事故，施工单位将承担相应的法律责任，包括民事赔偿、行政处罚甚至刑事责任。
施工进度与效率：
- 人员不足可能影响施工进度和效率，导致工程延期或成本增加。这同样可能引发业主的索赔或合同纠纷。
四、法律建议
立即整改：
- 施工单位应立即采取措施补充所需人员，确保满足合同和法律法规的要求。这有助于避免进一步的法律风险和损失。
与业主沟通：
- 施工单位应与业主进行积极沟通，说明人员配备不齐的原因和整改措施，争取业主的理解和支持。这有助于维护良好的合作关系和避免合同纠纷。
审查合同条款：
- 施工单位应仔细审查合同条款，特别是关于人员配备的要求和违约责任的规定。这有助于明确自身的权利和义务，并在必要时采取法律措施保护自己的合法权益。
寻求法律帮助：
- 若施工单位在人员配备问题上遇到复杂的法律问题或纠纷，应及时寻求专业律师的帮助。律师可以提供专业的法律意见和解决方案，帮助施工单位应对法律挑战。
总结：施工单位资质有效但人员配备不齐时，施工行为的有效性需结合具体情形判断。从合同效力、行政监管、实际施工效果等多个角度分析，施工单位应立即整改、与业主沟通、审查合同条款并在必要时寻求法律帮助。如有任何疑问或需要进一步的法律咨询，请直接向我提问。