若男方在知道被起诉离婚期间遭受了殴打，应立即采取以下措施保护自身权益，并视情况追究对方责任：

1. 确保人身安全，及时就医并保留证据
   若遭受暴力伤害，首要任务是确保自身安全，立即前往医院治疗，并保留所有医疗记录（如病历、诊断证明、伤情照片等）。这些证据是后续维权的关键，可证明伤害事实及程度。若伤情严重，可申请司法鉴定，明确伤害等级（如轻微伤、轻伤等），为后续法律程序提供依据。

2. 报警处理，追究对方行政或刑事责任
   根据《反家庭暴力法》及《治安管理处罚法》，殴打他人可能面临行政处罚（如拘留、罚款）；若造成轻伤及以上后果，则可能构成故意伤害罪，需承担刑事责任。男方应立即报警，由公安机关介入调查，固定证据（如监控录像、证人证言等）。若对方行为被认定为家庭暴力，还可依据《民法典》第1042条，在离婚诉讼中主张对方存在过错，要求损害赔偿。

3. 向法院申请人身安全保护令
   若担心对方继续实施暴力或骚扰，可依据《反家庭暴力法》第23条，向法院申请人身安全保护令。法院受理后，会禁止对方接近、骚扰、威胁申请人，违反者可能面临罚款、拘留等处罚。此措施能有效隔离暴力源，保障男方人身安全。

4. 在离婚诉讼中主张权益
   若离婚诉讼已启动，男方可将暴力行为作为对方存在过错的证据，依据《民法典》第1091条，主张多分财产或要求损害赔偿（包括物质赔偿与精神损害赔偿）。若暴力行为导致男方无法正常工作或生活，还可主张对方承担相应经济补偿。

5. 寻求心理支持与法律援助
   暴力事件可能对男方心理造成创伤，建议寻求专业心理咨询帮助。同时，若经济困难或案件复杂，可向当地法律援助中心申请法律援助，由律师协助处理诉讼及维权事宜。

总结：男方应优先保障人身安全，及时就医、报警并保留证据；通过法律途径追究对方责任，同时利用人身安全保护令隔离暴力；在离婚诉讼中充分主张权益，并寻求心理与法律支持。若需进一步分析具体案情或制定维权策略，可直接向我咨询。