结论：没打招呼离职，用人单位克扣农民工工资的行为，在大多数情况下是违法的。
分析：
劳动者离职的权利与义务：
- 劳动者享有自由离职的权利，但应当按照法律规定或劳动合同的约定，提前通知用人单位。这是劳动者的基本义务，旨在保障用人单位的正常运营秩序。
- 若劳动者未提前通知或未按照约定通知即离职，可能构成违约，但这并不直接赋予用人单位克扣工资的权利。
用人单位克扣工资的合法性：
- 根据《中华人民共和国劳动法》及相关规定，用人单位不得无故克扣或拖欠劳动者的工资。工资是劳动者提供劳动后应得的报酬，用人单位必须按时足额支付。
- 若劳动者因未提前通知离职给用人单位造成损失，用人单位可以通过合法途径（如提起劳动仲裁或诉讼）要求劳动者赔偿，但不得直接克扣工资作为赔偿。
特殊情况下的工资支付：
- 在某些特殊情况下，如劳动者严重违反用人单位规章制度、给用人单位造成重大损失等，用人单位可能依据内部规章制度或劳动合同约定对劳动者进行处罚，包括扣除部分工资。但这种处罚必须合法、合理，且不得违反法律法规的强制性规定。
- 对于农民工这一特殊群体，国家有更为严格的保护措施。用人单位不得以任何理由克扣或拖欠农民工工资，否则将面临法律制裁。
法律建议：
- 对于劳动者：若因未提前通知离职而被用人单位克扣工资，劳动者可以首先与用人单位协商解决；协商不成的，可以向当地劳动监察部门投诉或提起劳动仲裁申请，要求用人单位支付被克扣的工资。
- 对于用人单位：应严格遵守法律法规，不得无故克扣或拖欠劳动者工资。若劳动者未提前通知离职给用人单位造成损失，应通过合法途径要求赔偿，而非直接克扣工资。
可能后果：
- 若用人单位违法克扣工资，将面临劳动监察部门的处罚，包括罚款、责令改正等；情节严重的，还可能被列入失信名单，影响企业信誉和正常运营。
- 劳动者若因用人单位克扣工资而提起劳动仲裁或诉讼，用人单位可能面临支付被克扣工资、赔偿金等法律责任。
总结：没打招呼离职并不直接导致用人单位可以克扣农民工工资。用人单位应遵守法律法规，按时足额支付劳动者工资；劳动者也应履行提前通知的义务，以维护双方的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。