结论前置：商家少发货时，您申请仅退款的行为是否犯法，需分情况讨论。在大多数情况下，这属于民事纠纷范畴，不直接构成犯罪；但若存在特定情形，如数额较大且您具有非法占有目的，则可能涉及刑事犯罪。以下是对此问题的详细分析：
一、民事层面分析
合同关系与违约：在货物买卖合同中，商家有义务按照约定交付足额货物，您作为买家则有义务支付相应货款。若商家少发货，即违反了合同约定，您有权要求商家补足货物或采取其他补救措施。然而，若您在商家未补足货物的情况下直接申请仅退款，且未与商家协商一致，这可能构成您对合同的不当履行，商家有权要求您承担违约责任，如支付剩余货款或赔偿损失。
无权占有与返还：若您申请退款后，商家已同意退款但要求您返还货物，而您未返还或仅部分返还，且数额较小的，这构成无权占有。商家在请求返还无果后，可通过民事诉讼要求您返还原物或赔偿损失。
处理方式建议：面对商家少发货的情况，建议您首先与商家协商，要求商家补足货物或协商退款事宜。若协商无果，您可申请平台介入调解，或根据仲裁条款或事后达成的书面仲裁协议申请仲裁。对仲裁结果不服的，再向人民法院提起诉讼。
二、刑事层面分析
诈骗罪的可能性：若您明知商家少发货，却故意隐瞒事实，以非法占有为目的申请仅退款，且数额较大（通常指达到当地诈骗罪的立案标准，如三千元至一万元以上，具体标准因地区而异），则可能构成诈骗罪。此时，您需承担刑事责任，面临有期徒刑、拘役或罚金等处罚。
主观意图的认定：在判断是否构成诈骗罪时，关键在于您是否具有非法占有目的。若您因疏忽或误解而申请仅退款，且事后愿意补足货款或赔偿损失，则通常不构成诈骗罪。
三、综合建议与风险提示
诚信交易：在购物过程中，建议您保持诚信，如实反映问题，与商家协商解决。若商家存在过错，您有权要求商家承担相应责任；但若您故意隐瞒事实或采取不当手段获取利益，则可能面临法律风险。
法律途径解决：若与商家协商无果，建议您通过合法途径解决纠纷，如申请平台介入、调解、仲裁或诉讼等。避免采取过激行为或非法手段，以免加重自身法律责任。
关注数额与情节：在处理此类纠纷时，请务必关注涉及数额的大小和情节的严重程度。若数额较小且情节轻微，通常属于民事纠纷范畴；但若数额较大或情节严重，则可能涉及刑事犯罪。
最后，面对商家少发货的情况，您申请仅退款的行为是否犯法需根据具体情况判断。建议您在处理此类纠纷时保持冷静、理性，通过合法途径维护自身权益。若您有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。