当法院两次公告后被告仍不出庭，法院会根据案件性质（民事、行政或刑事）采取不同的处理措施。以下是对这一问题的详细分析：
一、民事案件中的处理
缺席判决：
- 法律依据：根据《中华人民共和国民事诉讼法》第一百四十七条，被告经传票传唤，无正当理由拒不到庭的，或者未经法庭许可中途退庭的，可以缺席判决。在公告送达的情况下，若公告期届满被告未出庭，即视为其放弃到庭答辩、质证等诉讼权利。
- 举例：在一起民间借贷纠纷案件中，原告起诉被告要求偿还借款，因无法直接联系到被告，法院采用公告送达方式向被告送达了起诉状副本、开庭传票等法律文书。公告期满后，被告未出庭应诉，法院依法进行了缺席审理，并根据原告提供的借条、转账记录等证据作出了判决，支持了原告的诉讼请求。
特殊情况处理：
- 如果法院认为有必要进一步查明案件事实，可能会尝试再次通过其他途径联系被告，如查询新的联系方式、向被告的亲属了解情况等，并再次进行传唤。但这种情况相对较少，且前提是法院有合理的理由认为有可能联系到被告。
二、行政案件中的处理
- 缺席判决：
- 法律依据：依据《中华人民共和国行政诉讼法》第五十八条，经人民法院传票传唤，被告无正当理由拒不到庭，或者未经法庭许可中途退庭的，可以缺席判决。在行政诉讼中，若行政机关作为被告经公告送达后不出庭，法院同样会依法进行缺席审理和判决。
- 举例：某企业对行政机关作出的行政处罚决定不服提起行政诉讼，法院通过公告送达方式向行政机关送达了相关法律文书，但行政机关未出庭。法院经审查认为行政行为证据确凿，适用法律、法规正确，符合法定程序，遂依法作出驳回原告诉讼请求的判决。
三、刑事案件中的处理
强制到庭（针对可拘传的被告人）：
- 对于必须到庭的被告人，如果经公告送达传票后仍不出庭，法院可以采取拘传措施。根据《中华人民共和国刑事诉讼法》的相关规定，对于不需要逮捕、拘留的犯罪嫌疑人，可以传唤到指定地点或者他的住所、所在单位进行讯问，对无正当理由拒不到案的，可以强制其到案接受讯问。不过，在刑事公诉案件中，通常不会仅因被告人不出庭就直接进入审判程序，而是会先确保其到庭。
中止审理或终止审理（特定情形）：
- 中止审理：如果在审判过程中，由于出现某些使审判在一定期限内无法继续进行的情况，如被告人患有严重疾病，无法出庭受审等，法院可能会裁定中止审理。待影响诉讼进行的原因消除后，再恢复审理。
- 终止审理：在某些极端情况下，如被告人死亡等，法院将依法终止审理。
四、建议与注意事项
被告方面：
- 如果被告确实有特殊原因无法出庭，应及时向法院提交书面申请并附上相关证明材料，申请延期开庭或采取其他适当措施。
- 被告可以委托代理人出庭，代理人可以进行答辩、提供证据、参与辩论等，以保护被告的合法权益。
原告方面：
- 原告应积极配合法院的审理工作，提供充分的证据以支持自己的诉求。
- 如果被告不出庭，原告应了解法院可能采取的措施，并做好相应的准备。
综上所述，当法院两次公告后被告仍不出庭时，法院会根据案件性质采取不同的处理措施。为避免不利后果，建议被告尽量按时出庭应诉，并积极维护自身的合法权益。如果确实有特殊原因无法出庭，应及时向法院提交书面申请并附上相关证明材料。同时，原告也应积极配合法院的审理工作。如有任何法律疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。