纪检委扣押手机发现婚外情且同居的情况，需分不同主体和性质来处理，具体如下：

1. 若涉及党员干部
   • 纪律处分层面：根据《中国共产党纪律处分条例》第一百三十五条规定，与他人发生不正当性关系，造成不良影响的，给予警告或者严重警告处分；情节较重的，给予撤销党内职务或者留党察看处分；情节严重的，给予开除党籍处分。利用职权、教养关系、从属关系或者其他相类似关系与他人发生性关系的，从重处分。党员干部有婚外情且同居的行为，严重违反了党的纪律，一般会根据情节轻重给予相应的纪律处分，从警告到开除党籍不等。
   • 其他影响：这种行为还可能影响党员干部的职务晋升、评优评先等。在组织考察、选拔任用过程中，此类不良行为记录会成为重要的考量因素，可能导致其失去晋升机会或者被取消已有的荣誉称号。
2. 若涉及普通公民
   • 道德层面：婚外情且同居的行为违背了社会公序良俗和婚姻道德准则，会受到社会舆论的谴责。这种行为可能会对家庭关系造成极大的破坏，导致夫妻感情破裂、家庭解体，对子女的成长也会产生负面影响，如造成子女心理创伤、影响其价值观形成等。
   • 法律层面（特定情况）：如果以夫妻名义共同生活，则可能涉嫌重婚罪。根据《中华人民共和国刑法》第二百五十八条规定，有配偶而重婚的，或者明知他人有配偶而与之结婚的，处二年以下有期徒刑或者拘役。不过，要构成重婚罪，需要满足一定的条件，即以夫妻名义公开共同生活，周围群众也认为他们是夫妻关系。如果仅仅是偶尔的婚外情同居，一般不构成重婚罪，但可能会在离婚诉讼中作为过错方，在财产分割、子女抚养等方面承担不利后果。例如，在离婚时，无过错方可以请求损害赔偿，法院在分割夫妻共同财产时，也会适当向无过错方倾斜。

如果遇到此类问题，你有任何疑问都可以直接向我咨询。