农业违法违规行为的管理涉及多个政府部门，具体哪个部门负责取决于违法违规行为的性质和内容。以下是一些常见农业违法违规行为及其对应的管理部门：

1. 土地资源与城乡规划违法：

   • 管理部门：县级自然资源部门（包括国土资源局）及乡（镇）人民政府。
   • 职责：负责土地资源的管理和监督，审查农业建设是否符合土地利用规划等相关规定。对于非法占用土地、擅自改变土地用途等违法违规行为，有权责令退还非法占用的土地，限期拆除在非法占用的土地上新建的建筑物和其他设施。乡（镇）人民政府则负责乡村规划的组织实施和监督管理工作，对未依法取得乡村建设规划许可证或未按许可证规定进行建设的行为，有权责令停止建设、限期改正；逾期不改正的，可拆除违规建筑。

2. 农村宅基地违法：

   • 管理部门：县级农业农村部门。
   • 职责：专注于农村宅基地管理，对违规占用宅基地建房、超标准多占宅基地等问题进行监督和查处。对于农户未经批准或采取欺骗手段骗取批准，非法占用土地建住宅的，有权责令退还非法占用的土地，限期拆除在非法占用的土地上新建的房屋。

3. 农业投入品违法（如农药、化肥等）：

   • 管理部门：县级农业农村部门及相关市场监管部门。
   • 职责：农业农村部门负责农业投入品的监管，确保农业投入品的质量安全。对于生产、销售假冒伪劣农业投入品的行为，农业农村部门有权进行查处。同时，市场监管部门也负责市场监管，对农业投入品的市场销售行为进行监督，打击违法行为。

4. 农产品质量安全违法：

   • 管理部门：县级农业农村部门及市场监管部门。
   • 职责：农业农村部门负责农产品质量安全的监管，确保农产品符合质量安全标准。对于生产、销售不符合质量安全标准的农产品的行为，农业农村部门有权进行查处。市场监管部门则负责市场上的农产品质量安全监管，对违法行为进行打击。

5. 农村干部违法乱纪（如贪污受贿、滥用职权等）：

   • 管理部门：纪检监察机关、政府相关部门（如农业农村部门）以及司法机关。
   • 职责：纪检监察机关负责监督农村干部的廉洁从政，对违纪违法行为进行调查核实，并给予相应的党纪政务处分。政府相关部门在发现违法乱纪线索时，有责任及时移送纪检监察机关或司法机关处理。司法机关则负责刑事追责，对构成犯罪的农村干部依法进行审判和制裁。

综合建议：

• 如果您发现农业违法违规行为，首先需要明确违法违规行为的性质和内容，以便确定向哪个部门反映和举报。
• 通常情况下，可以先向当地自然资源部门或农业农村部门报告，由其进行初步调查和认定。
• 若涉及乡村规划、宅基地管理或农村干部违法乱纪等问题，也可同时向乡（镇）人民政府或纪检监察机关寻求协助。
• 在反映和举报时，请尽可能提供详细的违法违规行为信息，包括时间、地点、涉及人员等，以便相关部门进行调查和处理。

如果您有具体的农业违法违规行为需要咨询或举报，请直接向我提问，我会根据您的具体情况提供更详细的法律建议和指导。