结论：公司让员工存休，离职时工资计算需分情况讨论，主要取决于存休的性质（是否为加班存休）、公司规章制度以及双方约定等因素。
若存休为加班存休，即员工在正常工作时间之外加班，公司安排调休但未实际调休，离职时应按加班工资标准支付工资
- 根据《劳动法》第四十四条，有下列情形之一的，用人单位应当按照下列标准支付高于劳动者正常工作时间工资的工资报酬：
- 安排劳动者延长工作时间的，支付不低于工资的百分之一百五十的工资报酬；
- 休息日安排劳动者工作又不能安排补休的，支付不低于工资的百分之二百的工资报酬；
- 法定休假日安排劳动者工作的，支付不低于工资的百分之三百的工资报酬。
- 如果公司安排员工在休息日加班，之后让员工存休（即记录可调休的时间），但员工离职时仍未调休完，那么对于这部分未调休的休息日加班时间，公司应按照不低于工资的百分之二百支付工资报酬；如果是工作日延长工作时间加班的存休，应按照不低于工资的百分之一百五十支付；法定休假日加班存休，则应按照不低于工资的百分之三百支付。
- 例如，员工小王每月工资 6000 元，某月休息日加班 2 天，公司安排存休，但小王离职时这 2 天存休未使用，那么公司应支付小王这 2 天的加班工资为：6000÷21.75×2×200% ≈ 1103.45 元（21.75 为月计薪天数）。
若存休并非加班存休，而是公司额外安排的休息且不计发工资，离职时一般无需额外支付工资，但需看公司规章制度和双方约定
- 有些公司可能会出于业务安排等原因，额外给员工安排一些休息时间（不属于法定加班后的调休），并且在这段休息时间内不计发工资，将这部分休息时间存起来。对于这种情况，如果公司规章制度中有明确规定，且员工在入职时知晓并同意，同时不违反法律法规的强制性规定，那么离职时公司一般无需就这部分存休额外支付工资。
- 但是，如果公司规章制度或双方约定不明确，或者该规定违反了法律法规的强制性规定（例如，变相降低员工工资等），那么员工有权要求公司按照正常工资标准支付相应工资。比如，公司规定员工每月有 2 天存休，这 2 天不支付工资，但这种规定导致员工实际工资低于当地最低工资标准，那么该规定就是无效的，员工离职时有权要求公司补足工资差额。
建议：如果遇到公司让员工存休，离职时工资计算有争议的情况，员工可以先与公司协商解决；协商不成的，可以向当地劳动监察部门投诉或者申请劳动仲裁，以维护自己的合法权益。如果你还有其他关于劳动法律方面的问题，欢迎随时向我咨询。