交通运输综合执法部门扣留大型车辆（大车）的主要法律条款依据及分析如下：

1. 《中华人民共和国道路交通安全法》的相关规定

   • 法律依据：根据《中华人民共和国道路交通安全法》第七十二条，交通警察有权对发生道路交通事故的车辆、物品、尸体、现场进行勘验检查，收集证据，并因收集证据的需要，扣留事故车辆。虽然该条款直接提及的是“交通警察”，但交通运输综合执法部门在特定情境下（如执行交通管理相关任务时），也可能依据此法律精神或相关授权进行类似操作，尤其是当其行为被明确授权或委托为交通管理的一部分时。不过，更直接和常见的依据是下文提到的行政处罚法及相关交通行政法规。
   • 应用场景：在交通事故调查中，若大车涉及事故，交通运输综合执法部门（在获得相应授权或委托的情况下）可能因调查需要而扣留车辆。

2. 《中华人民共和国行政处罚法》的相关规定

   • 法律依据：根据《中华人民共和国行政处罚法》第三十七条，行政机关在收集证据时，可以采取抽样取证的方法；在证据可能灭失或者以后难以取得的情况下，经行政机关负责人批准，可以先行登记保存，并应当在七日内及时作出处理决定，在此期间，当事人或者有关人员不得销毁或者转移证据。对于需要扣留的物品，如车辆，若其作为违法行为的工具或证据，且符合法定条件，行政机关可依法扣留。
   • 应用场景：若大车存在超载、超速、非法改装等违法行为，且证据可能因车辆移动而灭失或难以取得，交通运输综合执法部门可依法扣留车辆以进行进一步调查。

3. 具体交通行政法规及规章

   • 法律依据：除了上述两部法律外，还有一系列交通行政法规和规章对交通运输综合执法部门的扣车行为提供了具体依据，如《中华人民共和国道路运输条例》、《公路安全保护条例》等。这些法规和规章可能针对特定类型的违法行为（如非法营运、超限运输等）规定了扣留车辆的措施。
   • 应用场景举例：
     • 超限运输：若大车存在超限运输行为，根据《公路安全保护条例》的相关规定，交通运输综合执法部门有权扣留车辆，直至违法行为消除。
     • 非法营运：若大车未经许可从事道路运输经营，根据《中华人民共和国道路运输条例》的相关规定，交通运输综合执法部门可依法扣留车辆，并处以罚款等行政处罚。

法律建议与注意事项：

• 合法性审查：交通运输综合执法部门在扣留大车时，必须严格遵守法定程序和条件，确保扣车行为的合法性。
• 权利告知：在扣留车辆时，应向当事人告知扣留的理由、依据及救济途径，保障当事人的知情权。
• 及时处理：扣留车辆后，应尽快完成调查取证工作，并在法定期限内作出处理决定，避免超期扣留。
• 救济途径：若当事人对扣车行为有异议，可依法申请行政复议或提起行政诉讼，维护自身合法权益。

总结：交通运输综合执法部门扣留大车的法律条款主要依据《中华人民共和国道路交通安全法》、《中华人民共和国行政处罚法》以及相关交通行政法规和规章。在实际操作中，应严格遵守法定程序和条件，确保扣车行为的合法性和正当性。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。