交通管理部门对超限车辆进行扣车，主要依据的是《中华人民共和国道路交通安全法》、《公路安全保护条例》、《超限运输车辆行驶公路管理规定》以及《中华人民共和国公路法》中的相关条款。以下是对这些法律依据的详细解释：
《中华人民共和国道路交通安全法》：
- 该法第九十二条规定，货运机动车超过核定载质量的，由公安机关交通管理部门扣留机动车至违法状态消除，并处以相应罚款。这一条款明确赋予了交通管理部门对超限车辆进行扣车的权力，以确保道路交通安全。
《公路安全保护条例》：
- 条例第六十五条规定，对于未按指定时间、路线和速度行驶的超限运输车辆，或未随车携带超限运输车辆通行证的，公路管理机构或公安机关交通管理部门可扣留车辆。
- 第六十七条进一步规定，对于扰乱超限检测秩序或逃避超限检测的车辆，公路管理机构可强制拖离或扣留车辆，并处以罚款。这些条款为交通管理部门在超限车辆管理方面提供了有力的法律支持。
《超限运输车辆行驶公路管理规定》：
- 该规定第三条明确了超限运输车辆的定义，包括车货总高度、宽度、长度以及车货总质量的限定标准。这为交通管理部门判断车辆是否超限提供了明确的标准。
- 同时，该规定也赋予了公路管理机构在必要时扣押超限车辆的权力，以确保公路设施的安全和道路交通的顺畅。
《中华人民共和国公路法》：
- 该法第七十六条规定，对于擅自超限行驶等违法行为，交通主管部门可责令停止违法行为，并处以罚款。虽然这一条款并未直接提及扣车，但为交通管理部门对超限车辆进行处罚提供了法律依据，扣车作为处罚措施之一，也是基于这一法律框架下的合理延伸。
在实际操作中，交通管理部门会根据上述法律法规对超限车辆进行严格监管。对于违反规定的车辆，不仅可能面临罚款，还可能被扣留直至违法状态消除。因此，运输单位和驾驶员应严格遵守相关法律法规，确保车辆不超限超载，以保障道路交通安全和公路设施的完好。
如果您的车辆因超限被扣，建议您：
- 及时了解扣车原因和法律依据，确保自己的权益不受侵害。
- 配合交通管理部门的调查和处理，尽快消除违法状态，以便取回车辆。
- 如有异议或认为处理不当，可以依法申请行政复议或提起行政诉讼，维护自己的合法权益。
希望以上解答能对您有所帮助。如果您还有其他关于交通运输领域的法律问题，欢迎直接向我咨询。