在建设工程领域，关于工程合同中黑白合同的效力问题，可以明确以下几点核心结论：

1. 总体原则：以白合同为准

   • 根据《最高人民法院关于审理建设工程施工合同纠纷案件适用法律问题的解释（一）》的相关规定，当招标人和中标人另行签订的建设工程施工合同（即黑合同）与中标合同（即白合同）在工程范围、建设工期、工程质量、工程价款等实质性内容上存在不一致时，原则上应以白合同作为确定双方权利义务的依据。这一原则体现了对招投标程序及备案制度的尊重和保护，确保了工程建设的公开、公平、公正。

2. 必须招标的项目与非必须招标的项目区分处理

   • 必须进行招标的项目：对于大型基础设施、公用事业等关系社会公共利益、公众安全的项目，以及使用国有资金、国家融资或国际组织、外国政府贷款、援助资金的项目，必须进行招标。若这类项目经过了合法的招投标程序并签订了备案的白合同，之后签订的黑合同中与白合同实质性内容不一致的条款将无效。例如，若黑合同中约定的工程价款低于白合同，且该变更未经过合法程序，则该价款条款无效，仍应以白合同为准。
   • 非必须招标的项目：若项目非必须招标，但当事人自愿进行了招标并根据中标文件签订了备案的白合同，之后又签订了黑合同，同样应遵循以白合同为准的原则。若项目既未进行招标也未签订备案合同，而是直接签订了两份或多份实质性内容不一致的合同，则一般以实际履行的合同作为确定双方权利义务的依据。但需注意，若实际履行的合同存在违反法律法规强制性规定等无效情形，则不能作为结算依据。

3. 实质性内容变更的判断与处理

   • 实质性内容通常指工程范围、建设工期、工程质量、工程价款等核心条款。这些条款的变更将直接影响当事人的基本权利义务和工程建设的顺利进行。若黑白合同在非实质性内容上存在差异，如具体技术要求、局部设计变更等，且不影响合同主要权利义务，则一般不影响合同的效力，双方可按变更后的内容履行。但若变更涉及实质性内容，且未经过合法程序或未得到双方一致同意，则变更部分无效。

4. 合同签订时间与履行情况的影响

   • 签订时间：若黑合同签订在白合同之前，且白合同是根据中标文件签订的备案合同，则以白合同为准。若黑合同签订在后且存在实质性内容变更，原则上变更部分无效，但合理的工程变更、双方协商一致且不损害各方合法权益的除外。例如，因设计变更导致的工程量增加，双方可协商调整工程价款，但需确保变更程序合法且不损害第三方利益。
   • 履行情况：若双方实际履行的是黑合同，且该合同不存在违反法律法规强制性规定等无效情形，法院在处理时可能会考虑实际履行情况。但这需要具体情况具体分析，不能一概而论。例如，若黑合同中的价款条款虽低于白合同，但双方已实际履行且未损害国家、集体或第三人利益，法院可能会根据实际情况作出判断。

5. 合同无效的特殊情形

   • 若黑合同存在违反法律法规强制性规定的情况，如恶意串通损害国家、集体或第三人利益，以合法形式掩盖非法目的等，则该合同将被认定为无效。此时，无论白合同还是黑合同，均不能作为结算依据。双方需根据《民法典》等相关规定，按照各自过错程度承担相应责任。

法律建议：

• 在签订建设工程合同时，务必确保合同内容合法、合规，并严格遵守招投标程序及备案制度。
• 若需对合同内容进行变更，应确保变更程序合法且得到双方一致同意，避免签订内容不一致的黑白合同。
• 在合同履行过程中，应保留好相关证据材料，以便在发生纠纷时能够证明自己的主张。
• 若遇到复杂的法律问题或纠纷，建议及时向我咨询，以便得到专业、准确的法律意见和帮助。