商家故意缺斤短两，消费者有权要求商家进行民事赔偿，并可通过多种途径维护自身权益。以下是从不同角度为您详细分析的解答：
一、民事赔偿责任
补足商品数量：
- 商家应当按照商品实际标明的规格、重量，向消费者补足短缺的部分。例如，您购买5斤水果但只得到4斤，商家应再补给您1斤水果。
价款赔偿：
- 依据《中华人民共和国消费者权益保护法》第五十二条，商家因缺斤短两造成您财产损害的，除补足商品数量外，还应退还多收的价款。以购买5斤水果为例，若每斤10元，您实际支付50元但因缺斤短两只得到价值40元的水果，商家应退还您10元差价。
增加赔偿：
- 根据《中华人民共和国消费者权益保护法》第五十五条，若商家缺斤短两的行为被认定为欺诈，您有权要求增加赔偿。增加赔偿的金额为您购买商品的价款或接受服务的费用的三倍；若增加赔偿的金额不足五百元，则按五百元计算。例如，购买价值200元商品因缺斤短两被认定欺诈，您可额外获赔600元。
二、行政责任
- 市场监督管理部门等行政机关有权对商家缺斤短两的行为进行查处，并根据《计量法》等相关法律法规对商家进行罚款、没收违法所得、没收计量器具等行政处罚。情节严重的，可能会吊销其营业执照。商家被行政处罚并不影响其对您的民事赔偿责任。
三、消费者维权途径
与商家协商：
- 您首先应与商家进行协商，要求其按照法律规定进行赔偿。这是最直接、最快捷的解决方式。
向消费者协会投诉：
- 如果商家拒绝赔偿或协商无果，您可以向当地的消费者协会投诉，寻求帮助和调解。消费者协会会依法对商家的行为进行调查处理，并保护您的合法权益。
向行政部门申诉：
- 您还可以向工商行政管理部门等行政部门提出申诉，请求其介入处理。行政部门会依法对商家的行为进行调查，并可能采取罚款、责令整改等措施。
提起民事诉讼：
- 如果以上途径均无法解决问题，您可以选择向人民法院提起民事诉讼，要求法院依法裁决，促使商家履行赔偿义务。在诉讼过程中，您需要提供充分的证据证明商家的欺诈行为以及自己的实际损失。
四、维权注意事项
- 在维权过程中，您应保留好购物凭证（如发票、收据）、沟通记录（如短信、电话录音）等相关证据，以便更好地维护自己的权益。这些证据在协商、投诉、申诉或诉讼过程中都至关重要。
五、特殊情形下的赔偿
- 在某些情况下，如果缺斤短两导致您遭受了更严重的损害（如健康受损等），您还可以依据相关法律法规要求商家承担更重的赔偿责任，包括但不限于医疗费、误工费、护理费、交通费等实际支出的费用，以及精神损害赔偿等。
综上所述，商家故意缺斤短两的行为严重侵害了您的合法权益。您应充分了解自己的权利和法律途径，积极维护自身权益。同时，市场监督管理部门也应加强对商家的监管力度，确保市场公平交易秩序。如果您在维权过程中遇到任何问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。