该协议是否生效需分情况讨论，关键在于代签行为是否构成表见代理或是否得到被代签人的事后追认。以下从不同角度为您详细分析：

一、若代签行为构成表见代理，协议可能被认定为有效

表见代理是指行为人虽无代理权，但因被代理人的行为造成了足以使善意相对人相信其有代理权的表象，而与善意相对人进行的、由本人承担法律后果的代理行为。在全村代表签字的协议中，如果代签人长期以被代签人的名义参与村内事务，且被代签人对此明知却未提出异议，或者代签人持有被代签人的授权委托书（尽管该委托书可能是伪造的，但善意相对人无从知晓），那么善意相对人（即其他签字代表或协议相关方）有理由相信代签人有权代表被代签人签字。在此情况下，若协议内容不违反法律、行政法规的强制性规定，且不存在其他导致合同无效的情形，该协议可能被认定为有效。

法律依据：

• 《中华人民共和国民法典》第一百七十二条：“行为人没有代理权、超越代理权或者代理权终止后，仍然实施代理行为，相对人有理由相信行为人有代理权的，代理行为有效。”

二、若代签行为不构成表见代理，且未得到被代签人的事后追认，协议对被代签人不发生效力

如果代签行为明显超出了被代签人的授权范围，或者被代签人明确表示反对代签行为，且该反对意见在协议签订前或签订时已为善意相对人所知，那么代签行为不构成表见代理。在此情况下，若被代签人未对代签行为进行事后追认，那么该协议对被代签人不发生法律效力。但需要注意的是，协议对其他未涉及代签问题的签字代表仍然具有约束力。

法律依据：

• 《中华人民共和国民法典》第一百七十一条：“行为人没有代理权、超越代理权或者代理权终止后，仍然实施代理行为，未经被代理人追认的，对被代理人不发生效力。”

三、若代签行为涉嫌违法犯罪，协议可能因违法而无效

如果代签行为是通过伪造签名、印章等手段实施的，且该行为涉嫌伪造、变造、买卖国家机关公文、证件、印章罪或诈骗罪等违法犯罪行为，那么该协议可能因违反法律、行政法规的强制性规定而被认定为无效。此外，即使协议本身不因违法而无效，代签人也可能因违法犯罪行为而承担刑事责任。

法律依据：

• 《中华人民共和国民法典》第一百五十三条：“违反法律、行政法规的强制性规定的民事法律行为无效。但是，该强制性规定不导致该民事法律行为无效的除外。违背公序良俗的民事法律行为无效。”
• 《中华人民共和国刑法》第二百八十条：“伪造、变造、买卖或者盗窃、抢夺、毁灭国家机关的公文、证件、印章的，处三年以下有期徒刑、拘役、管制或者剥夺政治权利，并处罚金；情节严重的，处三年以上十年以下有期徒刑，并处罚金。”

四、建议措施

1. 核实代签情况：首先，应尽快核实代签行为的具体情况，包括代签人的身份、代签的原因、被代签人的态度等。
2. 协商解决：如果代签行为不构成违法犯罪，且被代签人愿意追认或协商解决，那么可以通过协商的方式对协议进行修改或补充，以明确各方的权利和义务。
3. 法律途径：如果协商无果，或者代签行为涉嫌违法犯罪，那么建议通过法律途径解决纠纷。可以依法向人民法院提起诉讼，要求确认协议的效力或撤销协议，并追究代签人的法律责任。

总结：全村代表签字的协议中发现有一人代签造假，该协议是否生效需根据具体情况判断。如果构成表见代理或得到被代签人的事后追认，协议可能有效；如果不构成表见代理且未得到追认，或者代签行为涉嫌违法犯罪，协议可能无效。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。